Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Brpf3B2KF05 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf3B2KF05 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms