Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scml2B1AVB3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scml2B1AVB3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms