Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M5A7VMS3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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