Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtcflA2APF3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtcflA2APF3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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