Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb4A2A863 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb4A2A863 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms