Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930469K13RikA0A286YDB2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms