Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms