Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trbv5A0A0B4J1G9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv5A0A0B4J1G9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv5A0A0B4J1G9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv5A0A0B4J1G9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv5A0A0B4J1G9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Trbv5A0A0B4J1G9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Trbv5A0A0B4J1G9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trbv5A0A0B4J1G9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trbv5A0A0B4J1G9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trbv5A0A0B4J1G9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trbv5A0A0B4J1G9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trbv5A0A0B4J1G9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trbv5A0A0B4J1G9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv5A0A0B4J1G9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Trbv5A0A0B4J1G9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms