Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CcniQ9Z2V9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcniQ9Z2V9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcniQ9Z2V9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcniQ9Z2V9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcniQ9Z2V9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcniQ9Z2V9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcniQ9Z2V9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CcniQ9Z2V9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CcniQ9Z2V9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcniQ9Z2V9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcniQ9Z2V9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcniQ9Z2V9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcniQ9Z2V9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcniQ9Z2V9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcniQ9Z2V9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcniQ9Z2V9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcniQ9Z2V9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcniQ9Z2V9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcniQ9Z2V9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcniQ9Z2V9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcniQ9Z2V9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcniQ9Z2V9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CcniQ9Z2V9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CcniQ9Z2V9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CcniQ9Z2V9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcniQ9Z2V9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CcniQ9Z2V9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CcniQ9Z2V9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CcniQ9Z2V9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CcniQ9Z2V9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CcniQ9Z2V9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcniQ9Z2V9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcniQ9Z2V9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcniQ9Z2V9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcniQ9Z2V9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcniQ9Z2V9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcniQ9Z2V9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcniQ9Z2V9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcniQ9Z2V9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CcniQ9Z2V9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcniQ9Z2V9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcniQ9Z2V9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcniQ9Z2V9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcniQ9Z2V9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcniQ9Z2V9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CcniQ9Z2V9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CcniQ9Z2V9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcniQ9Z2V9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcniQ9Z2V9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcniQ9Z2V9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CcniQ9Z2V9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcniQ9Z2V9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcniQ9Z2V9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcniQ9Z2V9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcniQ9Z2V9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcniQ9Z2V9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CcniQ9Z2V9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CcniQ9Z2V9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CcniQ9Z2V9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CcniQ9Z2V9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CcniQ9Z2V9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CcniQ9Z2V9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CcniQ9Z2V9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CcniQ9Z2V9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CcniQ9Z2V9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcniQ9Z2V9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcniQ9Z2V9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcniQ9Z2V9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CcniQ9Z2V9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CcniQ9Z2V9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CcniQ9Z2V9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CcniQ9Z2V9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CcniQ9Z2V9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcniQ9Z2V9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CcniQ9Z2V9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcniQ9Z2V9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcniQ9Z2V9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CcniQ9Z2V9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CcniQ9Z2V9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcniQ9Z2V9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcniQ9Z2V9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CcniQ9Z2V9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CcniQ9Z2V9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcniQ9Z2V9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcniQ9Z2V9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcniQ9Z2V9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcniQ9Z2V9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms