Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E4

Ppp1r17, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 17, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r17Q9Z2E4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r17Q9Z2E4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r17Q9Z2E4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r17Q9Z2E4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r17Q9Z2E4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r17Q9Z2E4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r17Q9Z2E4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r17Q9Z2E4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r17Q9Z2E4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r17Q9Z2E4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r17Q9Z2E4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r17Q9Z2E4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp1r17Q9Z2E4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r17Q9Z2E4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r17Q9Z2E4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r17Q9Z2E4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp1r17Q9Z2E4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r17Q9Z2E4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppp1r17Q9Z2E4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppp1r17Q9Z2E4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r17Q9Z2E4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r17Q9Z2E4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppp1r17Q9Z2E4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp1r17Q9Z2E4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp1r17Q9Z2E4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppp1r17Q9Z2E4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp1r17Q9Z2E4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppp1r17Q9Z2E4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp1r17Q9Z2E4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp1r17Q9Z2E4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1r17Q9Z2E4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1r17Q9Z2E4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r17Q9Z2E4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r17Q9Z2E4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r17Q9Z2E4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r17Q9Z2E4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r17Q9Z2E4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r17Q9Z2E4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r17Q9Z2E4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r17Q9Z2E4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r17Q9Z2E4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r17Q9Z2E4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r17Q9Z2E4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r17Q9Z2E4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r17Q9Z2E4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r17Q9Z2E4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r17Q9Z2E4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r17Q9Z2E4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r17Q9Z2E4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r17Q9Z2E4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r17Q9Z2E4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppp1r17Q9Z2E4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppp1r17Q9Z2E4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp1r17Q9Z2E4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp1r17Q9Z2E4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp1r17Q9Z2E4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp1r17Q9Z2E4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp1r17Q9Z2E4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppp1r17Q9Z2E4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r17Q9Z2E4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r17Q9Z2E4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r17Q9Z2E4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r17Q9Z2E4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r17Q9Z2E4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r17Q9Z2E4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r17Q9Z2E4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r17Q9Z2E4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r17Q9Z2E4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r17Q9Z2E4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r17Q9Z2E4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r17Q9Z2E4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r17Q9Z2E4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r17Q9Z2E4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms