Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z266

Snapin, SNARE-associated protein Snapin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnapinQ9Z266 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnapinQ9Z266 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnapinQ9Z266 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnapinQ9Z266 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SnapinQ9Z266 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnapinQ9Z266 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SnapinQ9Z266 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnapinQ9Z266 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SnapinQ9Z266 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SnapinQ9Z266 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SnapinQ9Z266 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SnapinQ9Z266 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SnapinQ9Z266 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnapinQ9Z266 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SnapinQ9Z266 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms