Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Stk39Q9Z1W9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Stk39Q9Z1W9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Stk39Q9Z1W9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,45■■■□□ 2,31
Stk39Q9Z1W9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Stk39Q9Z1W9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Stk39Q9Z1W9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Stk39Q9Z1W9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Stk39Q9Z1W9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Stk39Q9Z1W9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Stk39Q9Z1W9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Stk39Q9Z1W9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Stk39Q9Z1W9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Stk39Q9Z1W9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Stk39Q9Z1W9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Stk39Q9Z1W9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Stk39Q9Z1W9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Stk39Q9Z1W9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Stk39Q9Z1W9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Stk39Q9Z1W9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Stk39Q9Z1W9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Stk39Q9Z1W9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Stk39Q9Z1W9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Stk39Q9Z1W9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Stk39Q9Z1W9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,28■■■□□ 2,28
Stk39Q9Z1W9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Stk39Q9Z1W9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Stk39Q9Z1W9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Stk39Q9Z1W9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Stk39Q9Z1W9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Stk39Q9Z1W9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Stk39Q9Z1W9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Stk39Q9Z1W9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Stk39Q9Z1W9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Stk39Q9Z1W9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Stk39Q9Z1W9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Stk39Q9Z1W9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Stk39Q9Z1W9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Stk39Q9Z1W9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Stk39Q9Z1W9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Stk39Q9Z1W9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Stk39Q9Z1W9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Stk39Q9Z1W9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Stk39Q9Z1W9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Stk39Q9Z1W9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Stk39Q9Z1W9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Stk39Q9Z1W9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Stk39Q9Z1W9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Stk39Q9Z1W9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Stk39Q9Z1W9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Stk39Q9Z1W9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Stk39Q9Z1W9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Stk39Q9Z1W9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Stk39Q9Z1W9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Stk39Q9Z1W9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Stk39Q9Z1W9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Stk39Q9Z1W9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Stk39Q9Z1W9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Stk39Q9Z1W9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Stk39Q9Z1W9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Stk39Q9Z1W9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Stk39Q9Z1W9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Stk39Q9Z1W9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Stk39Q9Z1W9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Stk39Q9Z1W9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Stk39Q9Z1W9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Stk39Q9Z1W9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Stk39Q9Z1W9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Stk39Q9Z1W9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Stk39Q9Z1W9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Stk39Q9Z1W9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Stk39Q9Z1W9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Stk39Q9Z1W9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Stk39Q9Z1W9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Stk39Q9Z1W9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Stk39Q9Z1W9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Stk39Q9Z1W9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Stk39Q9Z1W9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Stk39Q9Z1W9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Stk39Q9Z1W9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Stk39Q9Z1W9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Stk39Q9Z1W9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Stk39Q9Z1W9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,89■■■□□ 2,21
Stk39Q9Z1W9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Stk39Q9Z1W9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Stk39Q9Z1W9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Stk39Q9Z1W9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Stk39Q9Z1W9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Stk39Q9Z1W9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Stk39Q9Z1W9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Stk39Q9Z1W9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Stk39Q9Z1W9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Stk39Q9Z1W9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Stk39Q9Z1W9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Stk39Q9Z1W9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Stk39Q9Z1W9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Stk39Q9Z1W9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Stk39Q9Z1W9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Stk39Q9Z1W9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Stk39Q9Z1W9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48,1 ms