Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Ap3b1Q9Z1T1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Ap3b1Q9Z1T1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Ap3b1Q9Z1T1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Ap3b1Q9Z1T1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Ap3b1Q9Z1T1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Ap3b1Q9Z1T1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ap3b1Q9Z1T1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Ap3b1Q9Z1T1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Ap3b1Q9Z1T1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Ap3b1Q9Z1T1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Ap3b1Q9Z1T1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Ap3b1Q9Z1T1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Ap3b1Q9Z1T1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Ap3b1Q9Z1T1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
Ap3b1Q9Z1T1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Ap3b1Q9Z1T1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Ap3b1Q9Z1T1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Ap3b1Q9Z1T1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ap3b1Q9Z1T1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ap3b1Q9Z1T1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Ap3b1Q9Z1T1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Ap3b1Q9Z1T1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
Ap3b1Q9Z1T1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ap3b1Q9Z1T1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ap3b1Q9Z1T1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ap3b1Q9Z1T1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Ap3b1Q9Z1T1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Ap3b1Q9Z1T1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Ap3b1Q9Z1T1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Ap3b1Q9Z1T1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Ap3b1Q9Z1T1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Ap3b1Q9Z1T1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Ap3b1Q9Z1T1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Ap3b1Q9Z1T1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Ap3b1Q9Z1T1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Ap3b1Q9Z1T1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Ap3b1Q9Z1T1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Ap3b1Q9Z1T1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Ap3b1Q9Z1T1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Ap3b1Q9Z1T1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Ap3b1Q9Z1T1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Ap3b1Q9Z1T1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Ap3b1Q9Z1T1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Ap3b1Q9Z1T1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ap3b1Q9Z1T1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ap3b1Q9Z1T1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ap3b1Q9Z1T1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Ap3b1Q9Z1T1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Ap3b1Q9Z1T1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Ap3b1Q9Z1T1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ap3b1Q9Z1T1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ap3b1Q9Z1T1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ap3b1Q9Z1T1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ap3b1Q9Z1T1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Ap3b1Q9Z1T1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Ap3b1Q9Z1T1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Ap3b1Q9Z1T1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ap3b1Q9Z1T1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ap3b1Q9Z1T1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Ap3b1Q9Z1T1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
Ap3b1Q9Z1T1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
Ap3b1Q9Z1T1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ap3b1Q9Z1T1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Ap3b1Q9Z1T1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ap3b1Q9Z1T1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
Ap3b1Q9Z1T1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Ap3b1Q9Z1T1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
Ap3b1Q9Z1T1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ap3b1Q9Z1T1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ap3b1Q9Z1T1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Ap3b1Q9Z1T1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ap3b1Q9Z1T1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms