Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40,2■■■■■ 4,03
Ap3b1Q9Z1T1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,19■■■■■ 4,02
Ap3b1Q9Z1T1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,19■■■■■ 4,02
Ap3b1Q9Z1T1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40,18■■■■■ 4,02
Ap3b1Q9Z1T1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC40,17■■■■■ 4,02
Ap3b1Q9Z1T1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,17■■■■■ 4,02
Ap3b1Q9Z1T1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
Ap3b1Q9Z1T1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
Ap3b1Q9Z1T1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,15■■■■■ 4,02
Ap3b1Q9Z1T1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,15■■■■■ 4,02
Ap3b1Q9Z1T1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC40,14■■■■■ 4,02
Ap3b1Q9Z1T1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,01
Ap3b1Q9Z1T1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC40,12■■■■■ 4,01
Ap3b1Q9Z1T1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40,1■■■■■ 4,01
Ap3b1Q9Z1T1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40,09■■■■■ 4,01
Ap3b1Q9Z1T1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC40,07■■■■■ 4,01
Ap3b1Q9Z1T1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,07■■■■■ 4
Ap3b1Q9Z1T1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,04■■■■■ 4
Ap3b1Q9Z1T1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,02■■■■■ 4
Ap3b1Q9Z1T1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Ap3b1Q9Z1T1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3,99
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40■■■■□ 3,99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC39,99■■■■□ 3,99
Ap3b1Q9Z1T1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,99■■■■□ 3,99
Ap3b1Q9Z1T1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,99■■■■□ 3,99
Ap3b1Q9Z1T1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,98■■■■□ 3,99
Ap3b1Q9Z1T1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,97■■■■□ 3,99
Ap3b1Q9Z1T1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,97■■■■□ 3,99
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,96■■■■□ 3,99
Ap3b1Q9Z1T1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC39,95■■■■□ 3,99
Ap3b1Q9Z1T1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
Ap3b1Q9Z1T1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
Ap3b1Q9Z1T1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
Ap3b1Q9Z1T1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,91■■■■□ 3,98
Ap3b1Q9Z1T1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,91■■■■□ 3,98
Ap3b1Q9Z1T1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39,9■■■■□ 3,98
Ap3b1Q9Z1T1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC39,9■■■■□ 3,98
Ap3b1Q9Z1T1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,89■■■■□ 3,98
Ap3b1Q9Z1T1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,84■■■■□ 3,97
Ap3b1Q9Z1T1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39,83■■■■□ 3,97
Ap3b1Q9Z1T1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,83■■■■□ 3,97
Ap3b1Q9Z1T1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC39,79■■■■□ 3,96
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,78■■■■□ 3,96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39,78■■■■□ 3,96
Ap3b1Q9Z1T1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,78■■■■□ 3,96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC39,77■■■■□ 3,96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC39,75■■■■□ 3,95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39,73■■■■□ 3,95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC39,73■■■■□ 3,95
Ap3b1Q9Z1T1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC39,72■■■■□ 3,95
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC39,7■■■■□ 3,95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
Ap3b1Q9Z1T1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC39,67■■■■□ 3,94
Ap3b1Q9Z1T1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,66■■■■□ 3,94
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC39,64■■■■□ 3,94
Ap3b1Q9Z1T1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,94
Ap3b1Q9Z1T1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,63■■■■□ 3,93
Ap3b1Q9Z1T1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC39,61■■■■□ 3,93
Ap3b1Q9Z1T1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,59■■■■□ 3,93
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC39,58■■■■□ 3,93
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,58■■■■□ 3,93
Ap3b1Q9Z1T1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC39,57■■■■□ 3,93
Ap3b1Q9Z1T1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39,54■■■■□ 3,92
Ap3b1Q9Z1T1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
Ap3b1Q9Z1T1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
Ap3b1Q9Z1T1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC39,52■■■■□ 3,92
Ap3b1Q9Z1T1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC39,5■■■■□ 3,91
Ap3b1Q9Z1T1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC39,5■■■■□ 3,91
Ap3b1Q9Z1T1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
Ap3b1Q9Z1T1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,49■■■■□ 3,91
Ap3b1Q9Z1T1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
Ap3b1Q9Z1T1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Ap3b1Q9Z1T1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Ap3b1Q9Z1T1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Ap3b1Q9Z1T1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Ap3b1Q9Z1T1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Ap3b1Q9Z1T1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Ap3b1Q9Z1T1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC39,43■■■■□ 3,9
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC39,43■■■■□ 3,9
Ap3b1Q9Z1T1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC39,4■■■■□ 3,9
Ap3b1Q9Z1T1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC39,39■■■■□ 3,9
Ap3b1Q9Z1T1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,37■■■■□ 3,89
Ap3b1Q9Z1T1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC39,36■■■■□ 3,89
Ap3b1Q9Z1T1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
Ap3b1Q9Z1T1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC39,33■■■■□ 3,89
Ap3b1Q9Z1T1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39,32■■■■□ 3,88
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
Ap3b1Q9Z1T1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC39,31■■■■□ 3,88
Ap3b1Q9Z1T1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,88
Ap3b1Q9Z1T1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Ap3b1Q9Z1T1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC39,24■■■■□ 3,87
Ap3b1Q9Z1T1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,24■■■■□ 3,87
Ap3b1Q9Z1T1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms