Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z125

Creb3l1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l1Q9Z125 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Creb3l1Q9Z125 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Creb3l1Q9Z125 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Creb3l1Q9Z125 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Creb3l1Q9Z125 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Creb3l1Q9Z125 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Creb3l1Q9Z125 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Creb3l1Q9Z125 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Creb3l1Q9Z125 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Creb3l1Q9Z125 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Creb3l1Q9Z125 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Creb3l1Q9Z125 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Creb3l1Q9Z125 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Creb3l1Q9Z125 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Creb3l1Q9Z125 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Creb3l1Q9Z125 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Creb3l1Q9Z125 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Creb3l1Q9Z125 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Creb3l1Q9Z125 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Creb3l1Q9Z125 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Creb3l1Q9Z125 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Creb3l1Q9Z125 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Creb3l1Q9Z125 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Creb3l1Q9Z125 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Creb3l1Q9Z125 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Creb3l1Q9Z125 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Creb3l1Q9Z125 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Creb3l1Q9Z125 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Creb3l1Q9Z125 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Creb3l1Q9Z125 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Creb3l1Q9Z125 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Creb3l1Q9Z125 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Creb3l1Q9Z125 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Creb3l1Q9Z125 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3l1Q9Z125 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Creb3l1Q9Z125 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3l1Q9Z125 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Creb3l1Q9Z125 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Creb3l1Q9Z125 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l1Q9Z125 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Creb3l1Q9Z125 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3l1Q9Z125 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l1Q9Z125 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l1Q9Z125 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l1Q9Z125 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l1Q9Z125 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l1Q9Z125 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l1Q9Z125 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3l1Q9Z125 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3l1Q9Z125 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Creb3l1Q9Z125 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Creb3l1Q9Z125 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3l1Q9Z125 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3l1Q9Z125 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3l1Q9Z125 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Creb3l1Q9Z125 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Creb3l1Q9Z125 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Creb3l1Q9Z125 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3l1Q9Z125 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3l1Q9Z125 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l1Q9Z125 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3l1Q9Z125 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3l1Q9Z125 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3l1Q9Z125 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Creb3l1Q9Z125 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3l1Q9Z125 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3l1Q9Z125 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3l1Q9Z125 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3l1Q9Z125 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3l1Q9Z125 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l1Q9Z125 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l1Q9Z125 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l1Q9Z125 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3l1Q9Z125 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Creb3l1Q9Z125 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l1Q9Z125 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l1Q9Z125 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l1Q9Z125 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l1Q9Z125 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l1Q9Z125 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l1Q9Z125 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l1Q9Z125 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l1Q9Z125 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l1Q9Z125 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3l1Q9Z125 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms