Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Skp2Q9Z0Z3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Skp2Q9Z0Z3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skp2Q9Z0Z3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skp2Q9Z0Z3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skp2Q9Z0Z3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skp2Q9Z0Z3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skp2Q9Z0Z3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skp2Q9Z0Z3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skp2Q9Z0Z3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Skp2Q9Z0Z3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Skp2Q9Z0Z3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skp2Q9Z0Z3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skp2Q9Z0Z3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skp2Q9Z0Z3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skp2Q9Z0Z3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skp2Q9Z0Z3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skp2Q9Z0Z3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skp2Q9Z0Z3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skp2Q9Z0Z3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skp2Q9Z0Z3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skp2Q9Z0Z3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skp2Q9Z0Z3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Skp2Q9Z0Z3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skp2Q9Z0Z3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skp2Q9Z0Z3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skp2Q9Z0Z3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skp2Q9Z0Z3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skp2Q9Z0Z3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skp2Q9Z0Z3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skp2Q9Z0Z3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Skp2Q9Z0Z3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skp2Q9Z0Z3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Skp2Q9Z0Z3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skp2Q9Z0Z3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Skp2Q9Z0Z3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Skp2Q9Z0Z3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skp2Q9Z0Z3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skp2Q9Z0Z3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skp2Q9Z0Z3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Skp2Q9Z0Z3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Skp2Q9Z0Z3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Skp2Q9Z0Z3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Skp2Q9Z0Z3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Skp2Q9Z0Z3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skp2Q9Z0Z3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Skp2Q9Z0Z3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skp2Q9Z0Z3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Skp2Q9Z0Z3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skp2Q9Z0Z3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skp2Q9Z0Z3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skp2Q9Z0Z3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skp2Q9Z0Z3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skp2Q9Z0Z3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skp2Q9Z0Z3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Skp2Q9Z0Z3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skp2Q9Z0Z3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Skp2Q9Z0Z3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Skp2Q9Z0Z3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skp2Q9Z0Z3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skp2Q9Z0Z3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skp2Q9Z0Z3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skp2Q9Z0Z3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skp2Q9Z0Z3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skp2Q9Z0Z3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skp2Q9Z0Z3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skp2Q9Z0Z3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skp2Q9Z0Z3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skp2Q9Z0Z3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skp2Q9Z0Z3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skp2Q9Z0Z3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skp2Q9Z0Z3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skp2Q9Z0Z3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skp2Q9Z0Z3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skp2Q9Z0Z3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms