Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cldn3Q9Z0G9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cldn3Q9Z0G9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cldn3Q9Z0G9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cldn3Q9Z0G9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cldn3Q9Z0G9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cldn3Q9Z0G9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cldn3Q9Z0G9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cldn3Q9Z0G9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cldn3Q9Z0G9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cldn3Q9Z0G9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cldn3Q9Z0G9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cldn3Q9Z0G9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cldn3Q9Z0G9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cldn3Q9Z0G9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cldn3Q9Z0G9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldn3Q9Z0G9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldn3Q9Z0G9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldn3Q9Z0G9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldn3Q9Z0G9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cldn3Q9Z0G9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cldn3Q9Z0G9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cldn3Q9Z0G9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cldn3Q9Z0G9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cldn3Q9Z0G9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cldn3Q9Z0G9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cldn3Q9Z0G9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cldn3Q9Z0G9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cldn3Q9Z0G9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cldn3Q9Z0G9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cldn3Q9Z0G9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cldn3Q9Z0G9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Cldn3Q9Z0G9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cldn3Q9Z0G9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cldn3Q9Z0G9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cldn3Q9Z0G9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cldn3Q9Z0G9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cldn3Q9Z0G9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cldn3Q9Z0G9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cldn3Q9Z0G9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldn3Q9Z0G9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldn3Q9Z0G9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldn3Q9Z0G9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldn3Q9Z0G9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cldn3Q9Z0G9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cldn3Q9Z0G9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cldn3Q9Z0G9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cldn3Q9Z0G9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cldn3Q9Z0G9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cldn3Q9Z0G9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cldn3Q9Z0G9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cldn3Q9Z0G9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cldn3Q9Z0G9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cldn3Q9Z0G9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cldn3Q9Z0G9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cldn3Q9Z0G9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cldn3Q9Z0G9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cldn3Q9Z0G9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cldn3Q9Z0G9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cldn3Q9Z0G9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cldn3Q9Z0G9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cldn3Q9Z0G9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cldn3Q9Z0G9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cldn3Q9Z0G9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cldn3Q9Z0G9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cldn3Q9Z0G9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cldn3Q9Z0G9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cldn3Q9Z0G9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cldn3Q9Z0G9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cldn3Q9Z0G9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cldn3Q9Z0G9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cldn3Q9Z0G9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cldn3Q9Z0G9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cldn3Q9Z0G9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cldn3Q9Z0G9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cldn3Q9Z0G9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cldn3Q9Z0G9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cldn3Q9Z0G9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cldn3Q9Z0G9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cldn3Q9Z0G9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cldn3Q9Z0G9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cldn3Q9Z0G9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cldn3Q9Z0G9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cldn3Q9Z0G9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cldn3Q9Z0G9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cldn3Q9Z0G9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cldn3Q9Z0G9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cldn3Q9Z0G9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cldn3Q9Z0G9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cldn3Q9Z0G9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cldn3Q9Z0G9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cldn3Q9Z0G9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cldn3Q9Z0G9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cldn3Q9Z0G9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cldn3Q9Z0G9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cldn3Q9Z0G9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cldn3Q9Z0G9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms