Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pacsin2Q9WVE8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pacsin2Q9WVE8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pacsin2Q9WVE8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pacsin2Q9WVE8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Pacsin2Q9WVE8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pacsin2Q9WVE8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pacsin2Q9WVE8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pacsin2Q9WVE8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pacsin2Q9WVE8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pacsin2Q9WVE8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pacsin2Q9WVE8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pacsin2Q9WVE8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pacsin2Q9WVE8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Pacsin2Q9WVE8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pacsin2Q9WVE8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pacsin2Q9WVE8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pacsin2Q9WVE8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pacsin2Q9WVE8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pacsin2Q9WVE8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pacsin2Q9WVE8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pacsin2Q9WVE8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pacsin2Q9WVE8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pacsin2Q9WVE8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pacsin2Q9WVE8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pacsin2Q9WVE8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pacsin2Q9WVE8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pacsin2Q9WVE8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pacsin2Q9WVE8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pacsin2Q9WVE8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pacsin2Q9WVE8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pacsin2Q9WVE8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pacsin2Q9WVE8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pacsin2Q9WVE8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pacsin2Q9WVE8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pacsin2Q9WVE8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pacsin2Q9WVE8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pacsin2Q9WVE8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Pacsin2Q9WVE8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pacsin2Q9WVE8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pacsin2Q9WVE8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pacsin2Q9WVE8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pacsin2Q9WVE8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pacsin2Q9WVE8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pacsin2Q9WVE8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pacsin2Q9WVE8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pacsin2Q9WVE8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pacsin2Q9WVE8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pacsin2Q9WVE8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pacsin2Q9WVE8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pacsin2Q9WVE8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pacsin2Q9WVE8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pacsin2Q9WVE8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pacsin2Q9WVE8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pacsin2Q9WVE8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pacsin2Q9WVE8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pacsin2Q9WVE8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pacsin2Q9WVE8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Pacsin2Q9WVE8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Pacsin2Q9WVE8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pacsin2Q9WVE8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pacsin2Q9WVE8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pacsin2Q9WVE8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pacsin2Q9WVE8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pacsin2Q9WVE8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pacsin2Q9WVE8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pacsin2Q9WVE8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pacsin2Q9WVE8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pacsin2Q9WVE8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pacsin2Q9WVE8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pacsin2Q9WVE8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pacsin2Q9WVE8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pacsin2Q9WVE8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pacsin2Q9WVE8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pacsin2Q9WVE8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pacsin2Q9WVE8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pacsin2Q9WVE8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pacsin2Q9WVE8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pacsin2Q9WVE8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pacsin2Q9WVE8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pacsin2Q9WVE8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pacsin2Q9WVE8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pacsin2Q9WVE8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pacsin2Q9WVE8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pacsin2Q9WVE8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pacsin2Q9WVE8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pacsin2Q9WVE8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pacsin2Q9WVE8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pacsin2Q9WVE8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pacsin2Q9WVE8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pacsin2Q9WVE8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pacsin2Q9WVE8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pacsin2Q9WVE8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pacsin2Q9WVE8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pacsin2Q9WVE8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pacsin2Q9WVE8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pacsin2Q9WVE8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms