Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,45■■■■□ 3,43
Slit3Q9WVB4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Slit3Q9WVB4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Slit3Q9WVB4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,41■■■■□ 3,42
Slit3Q9WVB4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Slit3Q9WVB4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Slit3Q9WVB4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36,34■■■■□ 3,41
Slit3Q9WVB4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Slit3Q9WVB4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Slit3Q9WVB4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36,33■■■■□ 3,41
Slit3Q9WVB4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,33■■■■□ 3,41
Slit3Q9WVB4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36,33■■■■□ 3,41
Slit3Q9WVB4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,41
Slit3Q9WVB4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36,32■■■■□ 3,4
Slit3Q9WVB4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Slit3Q9WVB4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,29■■■■□ 3,4
Slit3Q9WVB4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Slit3Q9WVB4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Slit3Q9WVB4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Slit3Q9WVB4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Slit3Q9WVB4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Slit3Q9WVB4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Slit3Q9WVB4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36,25■■■■□ 3,39
Slit3Q9WVB4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Slit3Q9WVB4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36,16■■■■□ 3,38
Slit3Q9WVB4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Slit3Q9WVB4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Slit3Q9WVB4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Slit3Q9WVB4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Slit3Q9WVB4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Slit3Q9WVB4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Slit3Q9WVB4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Slit3Q9WVB4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36,08■■■■□ 3,37
Slit3Q9WVB4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Slit3Q9WVB4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Slit3Q9WVB4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36,06■■■■□ 3,36
Slit3Q9WVB4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Slit3Q9WVB4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,03■■■■□ 3,36
Slit3Q9WVB4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Slit3Q9WVB4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36,02■■■■□ 3,36
Slit3Q9WVB4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,02■■■■□ 3,36
Slit3Q9WVB4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Slit3Q9WVB4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3,35
Slit3Q9WVB4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Slit3Q9WVB4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35,99■■■■□ 3,35
Slit3Q9WVB4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Slit3Q9WVB4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Slit3Q9WVB4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,98■■■■□ 3,35
Slit3Q9WVB4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Slit3Q9WVB4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Slit3Q9WVB4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Slit3Q9WVB4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Slit3Q9WVB4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,95■■■■□ 3,35
Slit3Q9WVB4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35,95■■■■□ 3,35
Slit3Q9WVB4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Slit3Q9WVB4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Slit3Q9WVB4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Slit3Q9WVB4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Slit3Q9WVB4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Slit3Q9WVB4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Slit3Q9WVB4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Slit3Q9WVB4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Slit3Q9WVB4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35,82■■■■□ 3,33
Slit3Q9WVB4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,33
Slit3Q9WVB4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Slit3Q9WVB4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Slit3Q9WVB4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35,76■■■■□ 3,32
Slit3Q9WVB4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Slit3Q9WVB4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35,75■■■■□ 3,31
Slit3Q9WVB4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Slit3Q9WVB4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35,73■■■■□ 3,31
Slit3Q9WVB4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35,71■■■■□ 3,31
Slit3Q9WVB4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Slit3Q9WVB4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Slit3Q9WVB4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Slit3Q9WVB4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Slit3Q9WVB4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Slit3Q9WVB4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35,66■■■■□ 3,3
Slit3Q9WVB4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Slit3Q9WVB4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Slit3Q9WVB4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35,64■■■■□ 3,3
Slit3Q9WVB4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Slit3Q9WVB4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,62■■■■□ 3,29
Slit3Q9WVB4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Slit3Q9WVB4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Slit3Q9WVB4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Slit3Q9WVB4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Slit3Q9WVB4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Slit3Q9WVB4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Slit3Q9WVB4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35,59■■■■□ 3,29
Slit3Q9WVB4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35,58■■■■□ 3,29
Slit3Q9WVB4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Slit3Q9WVB4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Slit3Q9WVB4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Slit3Q9WVB4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Slit3Q9WVB4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35,54■■■■□ 3,28
Slit3Q9WVB4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35,54■■■■□ 3,28
Slit3Q9WVB4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,52■■■■□ 3,28
Slit3Q9WVB4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
Slit3Q9WVB4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms