Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srd5a3Q9WUP4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srd5a3Q9WUP4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Srd5a3Q9WUP4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Srd5a3Q9WUP4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srd5a3Q9WUP4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Srd5a3Q9WUP4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srd5a3Q9WUP4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srd5a3Q9WUP4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Srd5a3Q9WUP4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Srd5a3Q9WUP4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Srd5a3Q9WUP4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srd5a3Q9WUP4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srd5a3Q9WUP4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srd5a3Q9WUP4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srd5a3Q9WUP4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srd5a3Q9WUP4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srd5a3Q9WUP4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srd5a3Q9WUP4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srd5a3Q9WUP4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srd5a3Q9WUP4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srd5a3Q9WUP4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srd5a3Q9WUP4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srd5a3Q9WUP4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srd5a3Q9WUP4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srd5a3Q9WUP4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srd5a3Q9WUP4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srd5a3Q9WUP4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Srd5a3Q9WUP4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srd5a3Q9WUP4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srd5a3Q9WUP4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srd5a3Q9WUP4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srd5a3Q9WUP4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Srd5a3Q9WUP4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srd5a3Q9WUP4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srd5a3Q9WUP4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Srd5a3Q9WUP4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srd5a3Q9WUP4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srd5a3Q9WUP4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srd5a3Q9WUP4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srd5a3Q9WUP4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srd5a3Q9WUP4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srd5a3Q9WUP4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srd5a3Q9WUP4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Srd5a3Q9WUP4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srd5a3Q9WUP4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srd5a3Q9WUP4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srd5a3Q9WUP4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srd5a3Q9WUP4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srd5a3Q9WUP4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Srd5a3Q9WUP4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srd5a3Q9WUP4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srd5a3Q9WUP4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srd5a3Q9WUP4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srd5a3Q9WUP4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srd5a3Q9WUP4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srd5a3Q9WUP4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srd5a3Q9WUP4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srd5a3Q9WUP4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srd5a3Q9WUP4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srd5a3Q9WUP4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srd5a3Q9WUP4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srd5a3Q9WUP4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srd5a3Q9WUP4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srd5a3Q9WUP4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srd5a3Q9WUP4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srd5a3Q9WUP4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms