Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrf1Q9WU00 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrf1Q9WU00 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrf1Q9WU00 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrf1Q9WU00 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrf1Q9WU00 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nrf1Q9WU00 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nrf1Q9WU00 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrf1Q9WU00 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nrf1Q9WU00 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrf1Q9WU00 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrf1Q9WU00 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrf1Q9WU00 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrf1Q9WU00 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrf1Q9WU00 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrf1Q9WU00 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrf1Q9WU00 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrf1Q9WU00 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrf1Q9WU00 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrf1Q9WU00 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrf1Q9WU00 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrf1Q9WU00 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrf1Q9WU00 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nrf1Q9WU00 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nrf1Q9WU00 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nrf1Q9WU00 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrf1Q9WU00 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrf1Q9WU00 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrf1Q9WU00 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrf1Q9WU00 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nrf1Q9WU00 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nrf1Q9WU00 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrf1Q9WU00 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nrf1Q9WU00 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrf1Q9WU00 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nrf1Q9WU00 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrf1Q9WU00 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrf1Q9WU00 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nrf1Q9WU00 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nrf1Q9WU00 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nrf1Q9WU00 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nrf1Q9WU00 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nrf1Q9WU00 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nrf1Q9WU00 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nrf1Q9WU00 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nrf1Q9WU00 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nrf1Q9WU00 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nrf1Q9WU00 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nrf1Q9WU00 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nrf1Q9WU00 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nrf1Q9WU00 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nrf1Q9WU00 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nrf1Q9WU00 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nrf1Q9WU00 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nrf1Q9WU00 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nrf1Q9WU00 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nrf1Q9WU00 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nrf1Q9WU00 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nrf1Q9WU00 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nrf1Q9WU00 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nrf1Q9WU00 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nrf1Q9WU00 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nrf1Q9WU00 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nrf1Q9WU00 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrf1Q9WU00 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrf1Q9WU00 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nrf1Q9WU00 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrf1Q9WU00 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nrf1Q9WU00 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrf1Q9WU00 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms