Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ5

Ramp1, Receptor activity-modifying protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp1Q9WTJ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ramp1Q9WTJ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ramp1Q9WTJ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ramp1Q9WTJ5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ramp1Q9WTJ5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ramp1Q9WTJ5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ramp1Q9WTJ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ramp1Q9WTJ5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ramp1Q9WTJ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ramp1Q9WTJ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ramp1Q9WTJ5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ramp1Q9WTJ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ramp1Q9WTJ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ramp1Q9WTJ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ramp1Q9WTJ5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ramp1Q9WTJ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ramp1Q9WTJ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ramp1Q9WTJ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ramp1Q9WTJ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ramp1Q9WTJ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ramp1Q9WTJ5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ramp1Q9WTJ5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ramp1Q9WTJ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ramp1Q9WTJ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ramp1Q9WTJ5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ramp1Q9WTJ5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ramp1Q9WTJ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ramp1Q9WTJ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ramp1Q9WTJ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ramp1Q9WTJ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ramp1Q9WTJ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ramp1Q9WTJ5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ramp1Q9WTJ5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ramp1Q9WTJ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ramp1Q9WTJ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ramp1Q9WTJ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ramp1Q9WTJ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ramp1Q9WTJ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ramp1Q9WTJ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ramp1Q9WTJ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ramp1Q9WTJ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ramp1Q9WTJ5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ramp1Q9WTJ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ramp1Q9WTJ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ramp1Q9WTJ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms