Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PplQ9R269 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PplQ9R269 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PplQ9R269 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
PplQ9R269 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PplQ9R269 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PplQ9R269 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PplQ9R269 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PplQ9R269 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PplQ9R269 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PplQ9R269 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PplQ9R269 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PplQ9R269 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
PplQ9R269 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PplQ9R269 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PplQ9R269 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PplQ9R269 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PplQ9R269 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PplQ9R269 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PplQ9R269 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PplQ9R269 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PplQ9R269 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
PplQ9R269 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PplQ9R269 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PplQ9R269 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PplQ9R269 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PplQ9R269 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PplQ9R269 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PplQ9R269 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PplQ9R269 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PplQ9R269 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PplQ9R269 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PplQ9R269 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PplQ9R269 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PplQ9R269 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PplQ9R269 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PplQ9R269 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PplQ9R269 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PplQ9R269 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PplQ9R269 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PplQ9R269 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PplQ9R269 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
PplQ9R269 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PplQ9R269 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PplQ9R269 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PplQ9R269 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PplQ9R269 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PplQ9R269 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PplQ9R269 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PplQ9R269 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PplQ9R269 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PplQ9R269 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PplQ9R269 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PplQ9R269 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PplQ9R269 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PplQ9R269 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PplQ9R269 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PplQ9R269 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PplQ9R269 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PplQ9R269 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PplQ9R269 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PplQ9R269 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PplQ9R269 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PplQ9R269 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PplQ9R269 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PplQ9R269 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PplQ9R269 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PplQ9R269 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PplQ9R269 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
PplQ9R269 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PplQ9R269 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PplQ9R269 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PplQ9R269 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PplQ9R269 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PplQ9R269 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PplQ9R269 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
PplQ9R269 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PplQ9R269 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PplQ9R269 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PplQ9R269 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PplQ9R269 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PplQ9R269 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PplQ9R269 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PplQ9R269 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PplQ9R269 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PplQ9R269 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PplQ9R269 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PplQ9R269 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PplQ9R269 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PplQ9R269 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PplQ9R269 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PplQ9R269 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PplQ9R269 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PplQ9R269 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PplQ9R269 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PplQ9R269 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PplQ9R269 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
PplQ9R269 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
PplQ9R269 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PplQ9R269 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms