Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpc2Q9R244 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpc2Q9R244 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpc2Q9R244 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpc2Q9R244 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Trpc2Q9R244 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpc2Q9R244 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpc2Q9R244 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpc2Q9R244 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpc2Q9R244 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpc2Q9R244 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpc2Q9R244 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpc2Q9R244 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpc2Q9R244 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpc2Q9R244 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpc2Q9R244 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trpc2Q9R244 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpc2Q9R244 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpc2Q9R244 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpc2Q9R244 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpc2Q9R244 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpc2Q9R244 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpc2Q9R244 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpc2Q9R244 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpc2Q9R244 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpc2Q9R244 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpc2Q9R244 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpc2Q9R244 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc2Q9R244 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpc2Q9R244 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpc2Q9R244 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpc2Q9R244 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpc2Q9R244 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpc2Q9R244 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpc2Q9R244 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpc2Q9R244 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpc2Q9R244 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpc2Q9R244 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpc2Q9R244 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpc2Q9R244 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpc2Q9R244 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpc2Q9R244 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpc2Q9R244 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpc2Q9R244 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpc2Q9R244 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Trpc2Q9R244 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpc2Q9R244 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpc2Q9R244 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpc2Q9R244 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpc2Q9R244 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trpc2Q9R244 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpc2Q9R244 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpc2Q9R244 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpc2Q9R244 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpc2Q9R244 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpc2Q9R244 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpc2Q9R244 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trpc2Q9R244 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpc2Q9R244 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpc2Q9R244 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpc2Q9R244 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpc2Q9R244 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpc2Q9R244 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpc2Q9R244 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpc2Q9R244 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trpc2Q9R244 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpc2Q9R244 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trpc2Q9R244 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpc2Q9R244 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpc2Q9R244 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trpc2Q9R244 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpc2Q9R244 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpc2Q9R244 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trpc2Q9R244 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpc2Q9R244 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpc2Q9R244 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpc2Q9R244 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpc2Q9R244 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpc2Q9R244 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpc2Q9R244 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpc2Q9R244 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpc2Q9R244 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpc2Q9R244 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpc2Q9R244 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trpc2Q9R244 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpc2Q9R244 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpc2Q9R244 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpc2Q9R244 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trpc2Q9R244 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trpc2Q9R244 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpc2Q9R244 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpc2Q9R244 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpc2Q9R244 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpc2Q9R244 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpc2Q9R244 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trpc2Q9R244 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpc2Q9R244 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpc2Q9R244 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trpc2Q9R244 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpc2Q9R244 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms