Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TapbpQ9R233 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TapbpQ9R233 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TapbpQ9R233 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TapbpQ9R233 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TapbpQ9R233 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TapbpQ9R233 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TapbpQ9R233 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TapbpQ9R233 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TapbpQ9R233 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TapbpQ9R233 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TapbpQ9R233 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TapbpQ9R233 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TapbpQ9R233 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TapbpQ9R233 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TapbpQ9R233 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TapbpQ9R233 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TapbpQ9R233 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TapbpQ9R233 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TapbpQ9R233 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TapbpQ9R233 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TapbpQ9R233 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TapbpQ9R233 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TapbpQ9R233 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TapbpQ9R233 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TapbpQ9R233 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TapbpQ9R233 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TapbpQ9R233 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TapbpQ9R233 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TapbpQ9R233 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TapbpQ9R233 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TapbpQ9R233 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TapbpQ9R233 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TapbpQ9R233 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TapbpQ9R233 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TapbpQ9R233 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TapbpQ9R233 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TapbpQ9R233 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TapbpQ9R233 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TapbpQ9R233 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TapbpQ9R233 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TapbpQ9R233 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TapbpQ9R233 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TapbpQ9R233 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TapbpQ9R233 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TapbpQ9R233 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TapbpQ9R233 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TapbpQ9R233 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TapbpQ9R233 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TapbpQ9R233 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TapbpQ9R233 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TapbpQ9R233 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TapbpQ9R233 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TapbpQ9R233 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TapbpQ9R233 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TapbpQ9R233 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TapbpQ9R233 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TapbpQ9R233 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TapbpQ9R233 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TapbpQ9R233 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TapbpQ9R233 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TapbpQ9R233 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TapbpQ9R233 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TapbpQ9R233 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TapbpQ9R233 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TapbpQ9R233 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TapbpQ9R233 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TapbpQ9R233 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TapbpQ9R233 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms