Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpk1Q9R0M5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpk1Q9R0M5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpk1Q9R0M5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpk1Q9R0M5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tpk1Q9R0M5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpk1Q9R0M5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tpk1Q9R0M5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tpk1Q9R0M5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpk1Q9R0M5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpk1Q9R0M5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpk1Q9R0M5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpk1Q9R0M5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpk1Q9R0M5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpk1Q9R0M5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpk1Q9R0M5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpk1Q9R0M5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpk1Q9R0M5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpk1Q9R0M5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpk1Q9R0M5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpk1Q9R0M5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpk1Q9R0M5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpk1Q9R0M5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpk1Q9R0M5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpk1Q9R0M5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpk1Q9R0M5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpk1Q9R0M5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpk1Q9R0M5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpk1Q9R0M5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpk1Q9R0M5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpk1Q9R0M5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpk1Q9R0M5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpk1Q9R0M5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpk1Q9R0M5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpk1Q9R0M5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpk1Q9R0M5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpk1Q9R0M5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpk1Q9R0M5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpk1Q9R0M5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpk1Q9R0M5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpk1Q9R0M5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpk1Q9R0M5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpk1Q9R0M5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpk1Q9R0M5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpk1Q9R0M5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpk1Q9R0M5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tpk1Q9R0M5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpk1Q9R0M5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpk1Q9R0M5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpk1Q9R0M5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpk1Q9R0M5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpk1Q9R0M5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpk1Q9R0M5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpk1Q9R0M5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpk1Q9R0M5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpk1Q9R0M5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpk1Q9R0M5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpk1Q9R0M5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpk1Q9R0M5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpk1Q9R0M5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpk1Q9R0M5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpk1Q9R0M5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpk1Q9R0M5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpk1Q9R0M5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpk1Q9R0M5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpk1Q9R0M5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpk1Q9R0M5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpk1Q9R0M5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpk1Q9R0M5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpk1Q9R0M5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpk1Q9R0M5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpk1Q9R0M5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpk1Q9R0M5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpk1Q9R0M5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms