Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrpxQ9R0M3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrpxQ9R0M3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrpxQ9R0M3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrpxQ9R0M3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrpxQ9R0M3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrpxQ9R0M3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrpxQ9R0M3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrpxQ9R0M3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrpxQ9R0M3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrpxQ9R0M3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrpxQ9R0M3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrpxQ9R0M3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrpxQ9R0M3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SrpxQ9R0M3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrpxQ9R0M3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrpxQ9R0M3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrpxQ9R0M3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrpxQ9R0M3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrpxQ9R0M3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrpxQ9R0M3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrpxQ9R0M3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SrpxQ9R0M3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SrpxQ9R0M3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrpxQ9R0M3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SrpxQ9R0M3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrpxQ9R0M3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrpxQ9R0M3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrpxQ9R0M3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrpxQ9R0M3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrpxQ9R0M3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrpxQ9R0M3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrpxQ9R0M3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrpxQ9R0M3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrpxQ9R0M3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrpxQ9R0M3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrpxQ9R0M3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrpxQ9R0M3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrpxQ9R0M3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrpxQ9R0M3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SrpxQ9R0M3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrpxQ9R0M3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SrpxQ9R0M3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SrpxQ9R0M3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SrpxQ9R0M3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SrpxQ9R0M3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrpxQ9R0M3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SrpxQ9R0M3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SrpxQ9R0M3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SrpxQ9R0M3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms