Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H0

Acox1, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acox1Q9R0H0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acox1Q9R0H0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acox1Q9R0H0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acox1Q9R0H0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acox1Q9R0H0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Acox1Q9R0H0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Acox1Q9R0H0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Acox1Q9R0H0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Acox1Q9R0H0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Acox1Q9R0H0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Acox1Q9R0H0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acox1Q9R0H0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acox1Q9R0H0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Acox1Q9R0H0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acox1Q9R0H0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acox1Q9R0H0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acox1Q9R0H0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acox1Q9R0H0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Acox1Q9R0H0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acox1Q9R0H0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acox1Q9R0H0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acox1Q9R0H0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acox1Q9R0H0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acox1Q9R0H0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acox1Q9R0H0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acox1Q9R0H0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acox1Q9R0H0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acox1Q9R0H0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Acox1Q9R0H0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acox1Q9R0H0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acox1Q9R0H0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acox1Q9R0H0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acox1Q9R0H0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acox1Q9R0H0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acox1Q9R0H0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acox1Q9R0H0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acox1Q9R0H0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acox1Q9R0H0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acox1Q9R0H0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acox1Q9R0H0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acox1Q9R0H0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acox1Q9R0H0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Acox1Q9R0H0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acox1Q9R0H0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acox1Q9R0H0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acox1Q9R0H0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acox1Q9R0H0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acox1Q9R0H0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acox1Q9R0H0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Acox1Q9R0H0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acox1Q9R0H0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acox1Q9R0H0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acox1Q9R0H0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acox1Q9R0H0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acox1Q9R0H0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acox1Q9R0H0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Acox1Q9R0H0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acox1Q9R0H0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acox1Q9R0H0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acox1Q9R0H0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acox1Q9R0H0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acox1Q9R0H0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acox1Q9R0H0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acox1Q9R0H0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acox1Q9R0H0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acox1Q9R0H0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acox1Q9R0H0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acox1Q9R0H0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acox1Q9R0H0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acox1Q9R0H0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acox1Q9R0H0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acox1Q9R0H0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acox1Q9R0H0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acox1Q9R0H0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acox1Q9R0H0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acox1Q9R0H0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acox1Q9R0H0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acox1Q9R0H0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acox1Q9R0H0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acox1Q9R0H0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acox1Q9R0H0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acox1Q9R0H0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acox1Q9R0H0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acox1Q9R0H0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acox1Q9R0H0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms