Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AmfrQ9R049 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AmfrQ9R049 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AmfrQ9R049 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AmfrQ9R049 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AmfrQ9R049 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AmfrQ9R049 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
AmfrQ9R049 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AmfrQ9R049 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AmfrQ9R049 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AmfrQ9R049 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AmfrQ9R049 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AmfrQ9R049 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AmfrQ9R049 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AmfrQ9R049 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AmfrQ9R049 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AmfrQ9R049 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
AmfrQ9R049 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AmfrQ9R049 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
AmfrQ9R049 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AmfrQ9R049 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
AmfrQ9R049 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AmfrQ9R049 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AmfrQ9R049 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AmfrQ9R049 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AmfrQ9R049 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AmfrQ9R049 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
AmfrQ9R049 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AmfrQ9R049 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AmfrQ9R049 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AmfrQ9R049 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AmfrQ9R049 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AmfrQ9R049 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
AmfrQ9R049 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
AmfrQ9R049 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AmfrQ9R049 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
AmfrQ9R049 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AmfrQ9R049 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AmfrQ9R049 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AmfrQ9R049 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AmfrQ9R049 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AmfrQ9R049 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AmfrQ9R049 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AmfrQ9R049 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AmfrQ9R049 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AmfrQ9R049 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AmfrQ9R049 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AmfrQ9R049 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AmfrQ9R049 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AmfrQ9R049 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AmfrQ9R049 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AmfrQ9R049 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AmfrQ9R049 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AmfrQ9R049 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AmfrQ9R049 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AmfrQ9R049 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AmfrQ9R049 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AmfrQ9R049 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AmfrQ9R049 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AmfrQ9R049 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AmfrQ9R049 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
AmfrQ9R049 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
AmfrQ9R049 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AmfrQ9R049 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AmfrQ9R049 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AmfrQ9R049 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AmfrQ9R049 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
AmfrQ9R049 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
AmfrQ9R049 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AmfrQ9R049 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
AmfrQ9R049 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AmfrQ9R049 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AmfrQ9R049 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AmfrQ9R049 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AmfrQ9R049 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AmfrQ9R049 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AmfrQ9R049 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AmfrQ9R049 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AmfrQ9R049 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AmfrQ9R049 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AmfrQ9R049 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AmfrQ9R049 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AmfrQ9R049 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AmfrQ9R049 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AmfrQ9R049 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AmfrQ9R049 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AmfrQ9R049 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
AmfrQ9R049 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AmfrQ9R049 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AmfrQ9R049 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AmfrQ9R049 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AmfrQ9R049 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AmfrQ9R049 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AmfrQ9R049 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AmfrQ9R049 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AmfrQ9R049 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AmfrQ9R049 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AmfrQ9R049 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
AmfrQ9R049 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AmfrQ9R049 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms