Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Six6Q9QZ28 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Six6Q9QZ28 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Six6Q9QZ28 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Six6Q9QZ28 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Six6Q9QZ28 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Six6Q9QZ28 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Six6Q9QZ28 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Six6Q9QZ28 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Six6Q9QZ28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Six6Q9QZ28 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Six6Q9QZ28 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Six6Q9QZ28 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Six6Q9QZ28 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Six6Q9QZ28 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Six6Q9QZ28 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Six6Q9QZ28 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Six6Q9QZ28 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Six6Q9QZ28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Six6Q9QZ28 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Six6Q9QZ28 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Six6Q9QZ28 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Six6Q9QZ28 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Six6Q9QZ28 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Six6Q9QZ28 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Six6Q9QZ28 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Six6Q9QZ28 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Six6Q9QZ28 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Six6Q9QZ28 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Six6Q9QZ28 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Six6Q9QZ28 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Six6Q9QZ28 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Six6Q9QZ28 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Six6Q9QZ28 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Six6Q9QZ28 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Six6Q9QZ28 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Six6Q9QZ28 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Six6Q9QZ28 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Six6Q9QZ28 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Six6Q9QZ28 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Six6Q9QZ28 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Six6Q9QZ28 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Six6Q9QZ28 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Six6Q9QZ28 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Six6Q9QZ28 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Six6Q9QZ28 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Six6Q9QZ28 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Six6Q9QZ28 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Six6Q9QZ28 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Six6Q9QZ28 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Six6Q9QZ28 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Six6Q9QZ28 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Six6Q9QZ28 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Six6Q9QZ28 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Six6Q9QZ28 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Six6Q9QZ28 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Six6Q9QZ28 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Six6Q9QZ28 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Six6Q9QZ28 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Six6Q9QZ28 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Six6Q9QZ28 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Six6Q9QZ28 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Six6Q9QZ28 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Six6Q9QZ28 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Six6Q9QZ28 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Six6Q9QZ28 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Six6Q9QZ28 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Six6Q9QZ28 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Six6Q9QZ28 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Six6Q9QZ28 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Six6Q9QZ28 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Six6Q9QZ28 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Six6Q9QZ28 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Six6Q9QZ28 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Six6Q9QZ28 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Six6Q9QZ28 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Six6Q9QZ28 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Six6Q9QZ28 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Six6Q9QZ28 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Six6Q9QZ28 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Six6Q9QZ28 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Six6Q9QZ28 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Six6Q9QZ28 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Six6Q9QZ28 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Six6Q9QZ28 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms