Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYC7

Ggcx, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GgcxQ9QYC7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GgcxQ9QYC7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GgcxQ9QYC7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GgcxQ9QYC7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GgcxQ9QYC7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GgcxQ9QYC7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GgcxQ9QYC7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GgcxQ9QYC7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GgcxQ9QYC7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GgcxQ9QYC7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GgcxQ9QYC7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GgcxQ9QYC7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GgcxQ9QYC7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GgcxQ9QYC7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GgcxQ9QYC7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GgcxQ9QYC7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GgcxQ9QYC7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GgcxQ9QYC7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GgcxQ9QYC7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GgcxQ9QYC7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GgcxQ9QYC7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GgcxQ9QYC7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GgcxQ9QYC7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GgcxQ9QYC7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GgcxQ9QYC7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GgcxQ9QYC7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GgcxQ9QYC7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GgcxQ9QYC7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GgcxQ9QYC7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GgcxQ9QYC7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GgcxQ9QYC7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GgcxQ9QYC7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GgcxQ9QYC7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GgcxQ9QYC7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GgcxQ9QYC7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GgcxQ9QYC7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GgcxQ9QYC7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GgcxQ9QYC7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GgcxQ9QYC7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GgcxQ9QYC7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GgcxQ9QYC7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GgcxQ9QYC7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GgcxQ9QYC7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GgcxQ9QYC7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GgcxQ9QYC7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GgcxQ9QYC7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GgcxQ9QYC7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GgcxQ9QYC7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GgcxQ9QYC7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GgcxQ9QYC7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GgcxQ9QYC7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GgcxQ9QYC7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GgcxQ9QYC7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GgcxQ9QYC7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GgcxQ9QYC7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GgcxQ9QYC7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GgcxQ9QYC7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GgcxQ9QYC7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GgcxQ9QYC7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GgcxQ9QYC7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GgcxQ9QYC7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GgcxQ9QYC7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GgcxQ9QYC7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GgcxQ9QYC7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GgcxQ9QYC7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GgcxQ9QYC7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GgcxQ9QYC7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GgcxQ9QYC7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GgcxQ9QYC7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GgcxQ9QYC7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GgcxQ9QYC7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GgcxQ9QYC7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GgcxQ9QYC7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GgcxQ9QYC7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GgcxQ9QYC7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GgcxQ9QYC7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GgcxQ9QYC7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GgcxQ9QYC7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GgcxQ9QYC7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GgcxQ9QYC7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GgcxQ9QYC7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GgcxQ9QYC7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GgcxQ9QYC7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GgcxQ9QYC7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GgcxQ9QYC7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms