Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Nphp1Q9QY53 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Nphp1Q9QY53 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Nphp1Q9QY53 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Nphp1Q9QY53 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31,51■■■□□ 2,63
Nphp1Q9QY53 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31,51■■■□□ 2,63
Nphp1Q9QY53 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Nphp1Q9QY53 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Nphp1Q9QY53 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Nphp1Q9QY53 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Nphp1Q9QY53 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Nphp1Q9QY53 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31,45■■■□□ 2,62
Nphp1Q9QY53 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Nphp1Q9QY53 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Nphp1Q9QY53 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Nphp1Q9QY53 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Nphp1Q9QY53 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Nphp1Q9QY53 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Nphp1Q9QY53 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Nphp1Q9QY53 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Nphp1Q9QY53 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31,37■■■□□ 2,61
Nphp1Q9QY53 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Nphp1Q9QY53 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Nphp1Q9QY53 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Nphp1Q9QY53 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Nphp1Q9QY53 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Nphp1Q9QY53 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Nphp1Q9QY53 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Nphp1Q9QY53 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Nphp1Q9QY53 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Nphp1Q9QY53 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Nphp1Q9QY53 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Nphp1Q9QY53 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Nphp1Q9QY53 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Nphp1Q9QY53 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Nphp1Q9QY53 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Nphp1Q9QY53 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Nphp1Q9QY53 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Nphp1Q9QY53 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Nphp1Q9QY53 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Nphp1Q9QY53 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Nphp1Q9QY53 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Nphp1Q9QY53 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Nphp1Q9QY53 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Nphp1Q9QY53 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Nphp1Q9QY53 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Nphp1Q9QY53 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Nphp1Q9QY53 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Nphp1Q9QY53 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Nphp1Q9QY53 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Nphp1Q9QY53 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31,17■■■□□ 2,58
Nphp1Q9QY53 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Nphp1Q9QY53 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Nphp1Q9QY53 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Nphp1Q9QY53 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Nphp1Q9QY53 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31,14■■■□□ 2,58
Nphp1Q9QY53 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Nphp1Q9QY53 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Nphp1Q9QY53 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Nphp1Q9QY53 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Nphp1Q9QY53 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Nphp1Q9QY53 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Nphp1Q9QY53 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Nphp1Q9QY53 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Nphp1Q9QY53 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Nphp1Q9QY53 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Nphp1Q9QY53 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Nphp1Q9QY53 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Nphp1Q9QY53 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Nphp1Q9QY53 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31■■■□□ 2,55
Nphp1Q9QY53 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Nphp1Q9QY53 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Nphp1Q9QY53 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Nphp1Q9QY53 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Nphp1Q9QY53 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
Nphp1Q9QY53 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Nphp1Q9QY53 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
Nphp1Q9QY53 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Nphp1Q9QY53 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Nphp1Q9QY53 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Nphp1Q9QY53 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Nphp1Q9QY53 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Nphp1Q9QY53 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30,93■■■□□ 2,54
Nphp1Q9QY53 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Nphp1Q9QY53 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Nphp1Q9QY53 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Nphp1Q9QY53 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Nphp1Q9QY53 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Nphp1Q9QY53 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Nphp1Q9QY53 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Nphp1Q9QY53 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Nphp1Q9QY53 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Nphp1Q9QY53 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Nphp1Q9QY53 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Nphp1Q9QY53 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Nphp1Q9QY53 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Nphp1Q9QY53 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30,82■■■□□ 2,52
Nphp1Q9QY53 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Nphp1Q9QY53 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Nphp1Q9QY53 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41,5 ms