Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Plxnb3Q9QY40 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Plxnb3Q9QY40 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Plxnb3Q9QY40 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Plxnb3Q9QY40 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Plxnb3Q9QY40 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Plxnb3Q9QY40 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Plxnb3Q9QY40 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Plxnb3Q9QY40 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Plxnb3Q9QY40 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Plxnb3Q9QY40 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Plxnb3Q9QY40 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Plxnb3Q9QY40 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Plxnb3Q9QY40 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Plxnb3Q9QY40 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Plxnb3Q9QY40 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Plxnb3Q9QY40 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Plxnb3Q9QY40 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Plxnb3Q9QY40 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
Plxnb3Q9QY40 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Plxnb3Q9QY40 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Plxnb3Q9QY40 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Plxnb3Q9QY40 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Plxnb3Q9QY40 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Plxnb3Q9QY40 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Plxnb3Q9QY40 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Plxnb3Q9QY40 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Plxnb3Q9QY40 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Plxnb3Q9QY40 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Plxnb3Q9QY40 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Plxnb3Q9QY40 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Plxnb3Q9QY40 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Plxnb3Q9QY40 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Plxnb3Q9QY40 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Plxnb3Q9QY40 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Plxnb3Q9QY40 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Plxnb3Q9QY40 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Plxnb3Q9QY40 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Plxnb3Q9QY40 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
Plxnb3Q9QY40 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Plxnb3Q9QY40 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Plxnb3Q9QY40 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Plxnb3Q9QY40 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Plxnb3Q9QY40 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Plxnb3Q9QY40 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Plxnb3Q9QY40 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,13
Plxnb3Q9QY40 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Plxnb3Q9QY40 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Plxnb3Q9QY40 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Plxnb3Q9QY40 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Plxnb3Q9QY40 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Plxnb3Q9QY40 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Plxnb3Q9QY40 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Plxnb3Q9QY40 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Plxnb3Q9QY40 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Plxnb3Q9QY40 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Plxnb3Q9QY40 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Plxnb3Q9QY40 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Plxnb3Q9QY40 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Plxnb3Q9QY40 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Plxnb3Q9QY40 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Plxnb3Q9QY40 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Plxnb3Q9QY40 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Plxnb3Q9QY40 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Plxnb3Q9QY40 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
Plxnb3Q9QY40 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Plxnb3Q9QY40 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Plxnb3Q9QY40 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Plxnb3Q9QY40 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Plxnb3Q9QY40 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Plxnb3Q9QY40 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Plxnb3Q9QY40 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Plxnb3Q9QY40 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Plxnb3Q9QY40 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Plxnb3Q9QY40 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Plxnb3Q9QY40 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Plxnb3Q9QY40 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Plxnb3Q9QY40 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Plxnb3Q9QY40 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Plxnb3Q9QY40 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Plxnb3Q9QY40 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
Plxnb3Q9QY40 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Plxnb3Q9QY40 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Plxnb3Q9QY40 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Plxnb3Q9QY40 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Plxnb3Q9QY40 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Plxnb3Q9QY40 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Plxnb3Q9QY40 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Plxnb3Q9QY40 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Plxnb3Q9QY40 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Plxnb3Q9QY40 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Plxnb3Q9QY40 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Plxnb3Q9QY40 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Plxnb3Q9QY40 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Plxnb3Q9QY40 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Plxnb3Q9QY40 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Plxnb3Q9QY40 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Plxnb3Q9QY40 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,08
Plxnb3Q9QY40 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,08
Plxnb3Q9QY40 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms