Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad18Q9QXK2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad18Q9QXK2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad18Q9QXK2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad18Q9QXK2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad18Q9QXK2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad18Q9QXK2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad18Q9QXK2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad18Q9QXK2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad18Q9QXK2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad18Q9QXK2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad18Q9QXK2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad18Q9QXK2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad18Q9QXK2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad18Q9QXK2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad18Q9QXK2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad18Q9QXK2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad18Q9QXK2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad18Q9QXK2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad18Q9QXK2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad18Q9QXK2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad18Q9QXK2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad18Q9QXK2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad18Q9QXK2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad18Q9QXK2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad18Q9QXK2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad18Q9QXK2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad18Q9QXK2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad18Q9QXK2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad18Q9QXK2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad18Q9QXK2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad18Q9QXK2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rad18Q9QXK2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad18Q9QXK2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rad18Q9QXK2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad18Q9QXK2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rad18Q9QXK2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rad18Q9QXK2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rad18Q9QXK2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rad18Q9QXK2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rad18Q9QXK2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rad18Q9QXK2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad18Q9QXK2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad18Q9QXK2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad18Q9QXK2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rad18Q9QXK2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad18Q9QXK2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad18Q9QXK2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad18Q9QXK2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad18Q9QXK2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rad18Q9QXK2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad18Q9QXK2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad18Q9QXK2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad18Q9QXK2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad18Q9QXK2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad18Q9QXK2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad18Q9QXK2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad18Q9QXK2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad18Q9QXK2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad18Q9QXK2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad18Q9QXK2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad18Q9QXK2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad18Q9QXK2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad18Q9QXK2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad18Q9QXK2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rad18Q9QXK2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad18Q9QXK2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad18Q9QXK2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad18Q9QXK2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad18Q9QXK2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad18Q9QXK2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad18Q9QXK2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad18Q9QXK2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad18Q9QXK2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad18Q9QXK2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad18Q9QXK2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad18Q9QXK2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad18Q9QXK2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms