Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ChmQ9QXG2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ChmQ9QXG2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ChmQ9QXG2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ChmQ9QXG2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ChmQ9QXG2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ChmQ9QXG2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ChmQ9QXG2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ChmQ9QXG2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ChmQ9QXG2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ChmQ9QXG2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ChmQ9QXG2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ChmQ9QXG2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ChmQ9QXG2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ChmQ9QXG2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
ChmQ9QXG2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ChmQ9QXG2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ChmQ9QXG2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ChmQ9QXG2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ChmQ9QXG2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ChmQ9QXG2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ChmQ9QXG2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ChmQ9QXG2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ChmQ9QXG2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ChmQ9QXG2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ChmQ9QXG2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ChmQ9QXG2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ChmQ9QXG2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ChmQ9QXG2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ChmQ9QXG2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ChmQ9QXG2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ChmQ9QXG2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ChmQ9QXG2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ChmQ9QXG2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ChmQ9QXG2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ChmQ9QXG2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ChmQ9QXG2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ChmQ9QXG2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ChmQ9QXG2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ChmQ9QXG2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ChmQ9QXG2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ChmQ9QXG2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ChmQ9QXG2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ChmQ9QXG2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ChmQ9QXG2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ChmQ9QXG2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ChmQ9QXG2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ChmQ9QXG2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ChmQ9QXG2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ChmQ9QXG2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ChmQ9QXG2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ChmQ9QXG2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ChmQ9QXG2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ChmQ9QXG2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ChmQ9QXG2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ChmQ9QXG2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ChmQ9QXG2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ChmQ9QXG2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ChmQ9QXG2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ChmQ9QXG2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ChmQ9QXG2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ChmQ9QXG2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ChmQ9QXG2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ChmQ9QXG2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ChmQ9QXG2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ChmQ9QXG2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ChmQ9QXG2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ChmQ9QXG2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ChmQ9QXG2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ChmQ9QXG2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ChmQ9QXG2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ChmQ9QXG2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ChmQ9QXG2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ChmQ9QXG2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ChmQ9QXG2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ChmQ9QXG2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ChmQ9QXG2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ChmQ9QXG2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ChmQ9QXG2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ChmQ9QXG2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ChmQ9QXG2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ChmQ9QXG2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ChmQ9QXG2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ChmQ9QXG2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ChmQ9QXG2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ChmQ9QXG2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ChmQ9QXG2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ChmQ9QXG2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ChmQ9QXG2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ChmQ9QXG2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ChmQ9QXG2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ChmQ9QXG2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ChmQ9QXG2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ChmQ9QXG2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ChmQ9QXG2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ChmQ9QXG2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ChmQ9QXG2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ChmQ9QXG2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ChmQ9QXG2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ChmQ9QXG2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms