Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PdcQ9QW08 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PdcQ9QW08 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PdcQ9QW08 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PdcQ9QW08 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PdcQ9QW08 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PdcQ9QW08 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PdcQ9QW08 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PdcQ9QW08 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PdcQ9QW08 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PdcQ9QW08 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PdcQ9QW08 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PdcQ9QW08 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PdcQ9QW08 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PdcQ9QW08 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PdcQ9QW08 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PdcQ9QW08 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PdcQ9QW08 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PdcQ9QW08 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PdcQ9QW08 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PdcQ9QW08 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PdcQ9QW08 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PdcQ9QW08 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PdcQ9QW08 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PdcQ9QW08 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PdcQ9QW08 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PdcQ9QW08 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PdcQ9QW08 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PdcQ9QW08 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PdcQ9QW08 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PdcQ9QW08 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PdcQ9QW08 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PdcQ9QW08 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PdcQ9QW08 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PdcQ9QW08 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PdcQ9QW08 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PdcQ9QW08 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PdcQ9QW08 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PdcQ9QW08 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PdcQ9QW08 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PdcQ9QW08 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PdcQ9QW08 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PdcQ9QW08 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PdcQ9QW08 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PdcQ9QW08 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PdcQ9QW08 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PdcQ9QW08 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PdcQ9QW08 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PdcQ9QW08 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PdcQ9QW08 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PdcQ9QW08 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PdcQ9QW08 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PdcQ9QW08 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PdcQ9QW08 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PdcQ9QW08 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PdcQ9QW08 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PdcQ9QW08 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PdcQ9QW08 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PdcQ9QW08 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PdcQ9QW08 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PdcQ9QW08 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PdcQ9QW08 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PdcQ9QW08 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PdcQ9QW08 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PdcQ9QW08 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PdcQ9QW08 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PdcQ9QW08 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PdcQ9QW08 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PdcQ9QW08 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PdcQ9QW08 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PdcQ9QW08 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PdcQ9QW08 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PdcQ9QW08 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PdcQ9QW08 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PdcQ9QW08 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PdcQ9QW08 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PdcQ9QW08 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PdcQ9QW08 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PdcQ9QW08 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PdcQ9QW08 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PdcQ9QW08 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PdcQ9QW08 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PdcQ9QW08 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PdcQ9QW08 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PdcQ9QW08 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PdcQ9QW08 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PdcQ9QW08 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PdcQ9QW08 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PdcQ9QW08 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PdcQ9QW08 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PdcQ9QW08 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PdcQ9QW08 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PdcQ9QW08 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PdcQ9QW08 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PdcQ9QW08 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PdcQ9QW08 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PdcQ9QW08 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PdcQ9QW08 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PdcQ9QW08 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PdcQ9QW08 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms