Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Tcea2Q9QVN7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,02■■□□□ 1,44
Tcea2Q9QVN7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Tcea2Q9QVN7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Tcea2Q9QVN7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Tcea2Q9QVN7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24■■□□□ 1,43
Tcea2Q9QVN7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Tcea2Q9QVN7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Tcea2Q9QVN7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Tcea2Q9QVN7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Tcea2Q9QVN7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Tcea2Q9QVN7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Tcea2Q9QVN7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Tcea2Q9QVN7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Tcea2Q9QVN7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Tcea2Q9QVN7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Tcea2Q9QVN7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Tcea2Q9QVN7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Tcea2Q9QVN7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Tcea2Q9QVN7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Tcea2Q9QVN7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Tcea2Q9QVN7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Tcea2Q9QVN7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Tcea2Q9QVN7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Tcea2Q9QVN7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Tcea2Q9QVN7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Tcea2Q9QVN7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Tcea2Q9QVN7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Tcea2Q9QVN7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Tcea2Q9QVN7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23,86■■□□□ 1,41
Tcea2Q9QVN7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Tcea2Q9QVN7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Tcea2Q9QVN7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Tcea2Q9QVN7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Tcea2Q9QVN7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Tcea2Q9QVN7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Tcea2Q9QVN7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Tcea2Q9QVN7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23,83■■□□□ 1,4
Tcea2Q9QVN7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Tcea2Q9QVN7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Tcea2Q9QVN7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Tcea2Q9QVN7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Tcea2Q9QVN7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Tcea2Q9QVN7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23,8■■□□□ 1,4
Tcea2Q9QVN7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Tcea2Q9QVN7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Tcea2Q9QVN7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Tcea2Q9QVN7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Tcea2Q9QVN7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Tcea2Q9QVN7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Tcea2Q9QVN7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Tcea2Q9QVN7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Tcea2Q9QVN7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Tcea2Q9QVN7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Tcea2Q9QVN7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Tcea2Q9QVN7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Tcea2Q9QVN7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Tcea2Q9QVN7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Tcea2Q9QVN7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Tcea2Q9QVN7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Tcea2Q9QVN7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23,7■■□□□ 1,38
Tcea2Q9QVN7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Tcea2Q9QVN7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Tcea2Q9QVN7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Tcea2Q9QVN7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Tcea2Q9QVN7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Tcea2Q9QVN7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23,66■■□□□ 1,38
Tcea2Q9QVN7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Tcea2Q9QVN7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Tcea2Q9QVN7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23,58■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Tcea2Q9QVN7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23,57■■□□□ 1,36
Tcea2Q9QVN7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Tcea2Q9QVN7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Tcea2Q9QVN7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Tcea2Q9QVN7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Tcea2Q9QVN7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23,55■■□□□ 1,36
Tcea2Q9QVN7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Tcea2Q9QVN7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Tcea2Q9QVN7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Tcea2Q9QVN7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Tcea2Q9QVN7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms