Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mid2Q9QUS6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mid2Q9QUS6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mid2Q9QUS6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mid2Q9QUS6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mid2Q9QUS6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mid2Q9QUS6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mid2Q9QUS6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mid2Q9QUS6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mid2Q9QUS6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mid2Q9QUS6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mid2Q9QUS6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mid2Q9QUS6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mid2Q9QUS6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mid2Q9QUS6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mid2Q9QUS6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mid2Q9QUS6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mid2Q9QUS6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mid2Q9QUS6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mid2Q9QUS6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mid2Q9QUS6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mid2Q9QUS6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mid2Q9QUS6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mid2Q9QUS6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mid2Q9QUS6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mid2Q9QUS6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mid2Q9QUS6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mid2Q9QUS6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mid2Q9QUS6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mid2Q9QUS6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mid2Q9QUS6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mid2Q9QUS6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mid2Q9QUS6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mid2Q9QUS6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mid2Q9QUS6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mid2Q9QUS6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mid2Q9QUS6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mid2Q9QUS6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mid2Q9QUS6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mid2Q9QUS6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mid2Q9QUS6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mid2Q9QUS6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mid2Q9QUS6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mid2Q9QUS6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mid2Q9QUS6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mid2Q9QUS6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mid2Q9QUS6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mid2Q9QUS6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mid2Q9QUS6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mid2Q9QUS6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mid2Q9QUS6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mid2Q9QUS6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mid2Q9QUS6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mid2Q9QUS6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mid2Q9QUS6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mid2Q9QUS6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mid2Q9QUS6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mid2Q9QUS6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mid2Q9QUS6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mid2Q9QUS6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mid2Q9QUS6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mid2Q9QUS6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mid2Q9QUS6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mid2Q9QUS6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mid2Q9QUS6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mid2Q9QUS6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mid2Q9QUS6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mid2Q9QUS6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mid2Q9QUS6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms