Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gkap1Q9JMB0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gkap1Q9JMB0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gkap1Q9JMB0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gkap1Q9JMB0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gkap1Q9JMB0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gkap1Q9JMB0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gkap1Q9JMB0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gkap1Q9JMB0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gkap1Q9JMB0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gkap1Q9JMB0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gkap1Q9JMB0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gkap1Q9JMB0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gkap1Q9JMB0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gkap1Q9JMB0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gkap1Q9JMB0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gkap1Q9JMB0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gkap1Q9JMB0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gkap1Q9JMB0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gkap1Q9JMB0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gkap1Q9JMB0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gkap1Q9JMB0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gkap1Q9JMB0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gkap1Q9JMB0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gkap1Q9JMB0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gkap1Q9JMB0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gkap1Q9JMB0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gkap1Q9JMB0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gkap1Q9JMB0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gkap1Q9JMB0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gkap1Q9JMB0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gkap1Q9JMB0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gkap1Q9JMB0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gkap1Q9JMB0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gkap1Q9JMB0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gkap1Q9JMB0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gkap1Q9JMB0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gkap1Q9JMB0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gkap1Q9JMB0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gkap1Q9JMB0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gkap1Q9JMB0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gkap1Q9JMB0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gkap1Q9JMB0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gkap1Q9JMB0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gkap1Q9JMB0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gkap1Q9JMB0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gkap1Q9JMB0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gkap1Q9JMB0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gkap1Q9JMB0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gkap1Q9JMB0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gkap1Q9JMB0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gkap1Q9JMB0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gkap1Q9JMB0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gkap1Q9JMB0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gkap1Q9JMB0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gkap1Q9JMB0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gkap1Q9JMB0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gkap1Q9JMB0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gkap1Q9JMB0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gkap1Q9JMB0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gkap1Q9JMB0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gkap1Q9JMB0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gkap1Q9JMB0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gkap1Q9JMB0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gkap1Q9JMB0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gkap1Q9JMB0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gkap1Q9JMB0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gkap1Q9JMB0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gkap1Q9JMB0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gkap1Q9JMB0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gkap1Q9JMB0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gkap1Q9JMB0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gkap1Q9JMB0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gkap1Q9JMB0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gkap1Q9JMB0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gkap1Q9JMB0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gkap1Q9JMB0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gkap1Q9JMB0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gkap1Q9JMB0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gkap1Q9JMB0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gkap1Q9JMB0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gkap1Q9JMB0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gkap1Q9JMB0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gkap1Q9JMB0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gkap1Q9JMB0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gkap1Q9JMB0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gkap1Q9JMB0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gkap1Q9JMB0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gkap1Q9JMB0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gkap1Q9JMB0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gkap1Q9JMB0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gkap1Q9JMB0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gkap1Q9JMB0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gkap1Q9JMB0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gkap1Q9JMB0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gkap1Q9JMB0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gkap1Q9JMB0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gkap1Q9JMB0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gkap1Q9JMB0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gkap1Q9JMB0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms