Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLY0

Socs6, Suppressor of cytokine signaling 6, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs6Q9JLY0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Socs6Q9JLY0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Socs6Q9JLY0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Socs6Q9JLY0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Socs6Q9JLY0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Socs6Q9JLY0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Socs6Q9JLY0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Socs6Q9JLY0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Socs6Q9JLY0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Socs6Q9JLY0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Socs6Q9JLY0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Socs6Q9JLY0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Socs6Q9JLY0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Socs6Q9JLY0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Socs6Q9JLY0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Socs6Q9JLY0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Socs6Q9JLY0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Socs6Q9JLY0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Socs6Q9JLY0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Socs6Q9JLY0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Socs6Q9JLY0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Socs6Q9JLY0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Socs6Q9JLY0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Socs6Q9JLY0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Socs6Q9JLY0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Socs6Q9JLY0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Socs6Q9JLY0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Socs6Q9JLY0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Socs6Q9JLY0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Socs6Q9JLY0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Socs6Q9JLY0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Socs6Q9JLY0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Socs6Q9JLY0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Socs6Q9JLY0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Socs6Q9JLY0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Socs6Q9JLY0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Socs6Q9JLY0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Socs6Q9JLY0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Socs6Q9JLY0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Socs6Q9JLY0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Socs6Q9JLY0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Socs6Q9JLY0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Socs6Q9JLY0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Socs6Q9JLY0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Socs6Q9JLY0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Socs6Q9JLY0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Socs6Q9JLY0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Socs6Q9JLY0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Socs6Q9JLY0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Socs6Q9JLY0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Socs6Q9JLY0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Socs6Q9JLY0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Socs6Q9JLY0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Socs6Q9JLY0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Socs6Q9JLY0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Socs6Q9JLY0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Socs6Q9JLY0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Socs6Q9JLY0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Socs6Q9JLY0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Socs6Q9JLY0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Socs6Q9JLY0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Socs6Q9JLY0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Socs6Q9JLY0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Socs6Q9JLY0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Socs6Q9JLY0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Socs6Q9JLY0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Socs6Q9JLY0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Socs6Q9JLY0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Socs6Q9JLY0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Socs6Q9JLY0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Socs6Q9JLY0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Socs6Q9JLY0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Socs6Q9JLY0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Socs6Q9JLY0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Socs6Q9JLY0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Socs6Q9JLY0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Socs6Q9JLY0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Socs6Q9JLY0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Socs6Q9JLY0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Socs6Q9JLY0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Socs6Q9JLY0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Socs6Q9JLY0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Socs6Q9JLY0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Socs6Q9JLY0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Socs6Q9JLY0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Socs6Q9JLY0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Socs6Q9JLY0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Socs6Q9JLY0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Socs6Q9JLY0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Socs6Q9JLY0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Socs6Q9JLY0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Socs6Q9JLY0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Socs6Q9JLY0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Socs6Q9JLY0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Socs6Q9JLY0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Socs6Q9JLY0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Socs6Q9JLY0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Socs6Q9JLY0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Socs6Q9JLY0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Socs6Q9JLY0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms