Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dclk1Q9JLM8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dclk1Q9JLM8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dclk1Q9JLM8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Dclk1Q9JLM8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dclk1Q9JLM8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Dclk1Q9JLM8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dclk1Q9JLM8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dclk1Q9JLM8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dclk1Q9JLM8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dclk1Q9JLM8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Dclk1Q9JLM8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dclk1Q9JLM8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dclk1Q9JLM8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Dclk1Q9JLM8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dclk1Q9JLM8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dclk1Q9JLM8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dclk1Q9JLM8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dclk1Q9JLM8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dclk1Q9JLM8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Dclk1Q9JLM8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dclk1Q9JLM8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dclk1Q9JLM8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Dclk1Q9JLM8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dclk1Q9JLM8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dclk1Q9JLM8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dclk1Q9JLM8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dclk1Q9JLM8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dclk1Q9JLM8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dclk1Q9JLM8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dclk1Q9JLM8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dclk1Q9JLM8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dclk1Q9JLM8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dclk1Q9JLM8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dclk1Q9JLM8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dclk1Q9JLM8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dclk1Q9JLM8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dclk1Q9JLM8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dclk1Q9JLM8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dclk1Q9JLM8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Dclk1Q9JLM8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Dclk1Q9JLM8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Dclk1Q9JLM8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Dclk1Q9JLM8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dclk1Q9JLM8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dclk1Q9JLM8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dclk1Q9JLM8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dclk1Q9JLM8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Dclk1Q9JLM8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dclk1Q9JLM8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dclk1Q9JLM8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dclk1Q9JLM8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dclk1Q9JLM8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dclk1Q9JLM8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Dclk1Q9JLM8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dclk1Q9JLM8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dclk1Q9JLM8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dclk1Q9JLM8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Dclk1Q9JLM8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dclk1Q9JLM8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Dclk1Q9JLM8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dclk1Q9JLM8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dclk1Q9JLM8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dclk1Q9JLM8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dclk1Q9JLM8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dclk1Q9JLM8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dclk1Q9JLM8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dclk1Q9JLM8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dclk1Q9JLM8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dclk1Q9JLM8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dclk1Q9JLM8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dclk1Q9JLM8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dclk1Q9JLM8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dclk1Q9JLM8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dclk1Q9JLM8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dclk1Q9JLM8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Dclk1Q9JLM8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dclk1Q9JLM8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Dclk1Q9JLM8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dclk1Q9JLM8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dclk1Q9JLM8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dclk1Q9JLM8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dclk1Q9JLM8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dclk1Q9JLM8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dclk1Q9JLM8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms