Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CtsmQ9JL96 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CtsmQ9JL96 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CtsmQ9JL96 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CtsmQ9JL96 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CtsmQ9JL96 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CtsmQ9JL96 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CtsmQ9JL96 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CtsmQ9JL96 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CtsmQ9JL96 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CtsmQ9JL96 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CtsmQ9JL96 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtsmQ9JL96 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtsmQ9JL96 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CtsmQ9JL96 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CtsmQ9JL96 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CtsmQ9JL96 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CtsmQ9JL96 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CtsmQ9JL96 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CtsmQ9JL96 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CtsmQ9JL96 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CtsmQ9JL96 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CtsmQ9JL96 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtsmQ9JL96 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtsmQ9JL96 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtsmQ9JL96 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CtsmQ9JL96 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtsmQ9JL96 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtsmQ9JL96 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtsmQ9JL96 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CtsmQ9JL96 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CtsmQ9JL96 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtsmQ9JL96 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtsmQ9JL96 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CtsmQ9JL96 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CtsmQ9JL96 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CtsmQ9JL96 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CtsmQ9JL96 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CtsmQ9JL96 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CtsmQ9JL96 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CtsmQ9JL96 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CtsmQ9JL96 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CtsmQ9JL96 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CtsmQ9JL96 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CtsmQ9JL96 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CtsmQ9JL96 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CtsmQ9JL96 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CtsmQ9JL96 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CtsmQ9JL96 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CtsmQ9JL96 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtsmQ9JL96 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CtsmQ9JL96 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CtsmQ9JL96 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CtsmQ9JL96 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CtsmQ9JL96 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CtsmQ9JL96 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CtsmQ9JL96 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CtsmQ9JL96 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CtsmQ9JL96 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CtsmQ9JL96 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CtsmQ9JL96 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CtsmQ9JL96 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CtsmQ9JL96 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtsmQ9JL96 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CtsmQ9JL96 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CtsmQ9JL96 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CtsmQ9JL96 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CtsmQ9JL96 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CtsmQ9JL96 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CtsmQ9JL96 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CtsmQ9JL96 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CtsmQ9JL96 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CtsmQ9JL96 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CtsmQ9JL96 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CtsmQ9JL96 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CtsmQ9JL96 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CtsmQ9JL96 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CtsmQ9JL96 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CtsmQ9JL96 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CtsmQ9JL96 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CtsmQ9JL96 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CtsmQ9JL96 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CtsmQ9JL96 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CtsmQ9JL96 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CtsmQ9JL96 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CtsmQ9JL96 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CtsmQ9JL96 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CtsmQ9JL96 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CtsmQ9JL96 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CtsmQ9JL96 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CtsmQ9JL96 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CtsmQ9JL96 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms