Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufaf3Q9JKL4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufaf3Q9JKL4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufaf3Q9JKL4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufaf3Q9JKL4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufaf3Q9JKL4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf3Q9JKL4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf3Q9JKL4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf3Q9JKL4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufaf3Q9JKL4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufaf3Q9JKL4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufaf3Q9JKL4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufaf3Q9JKL4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufaf3Q9JKL4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufaf3Q9JKL4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufaf3Q9JKL4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufaf3Q9JKL4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufaf3Q9JKL4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf3Q9JKL4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufaf3Q9JKL4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufaf3Q9JKL4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufaf3Q9JKL4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufaf3Q9JKL4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufaf3Q9JKL4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufaf3Q9JKL4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufaf3Q9JKL4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufaf3Q9JKL4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufaf3Q9JKL4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufaf3Q9JKL4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufaf3Q9JKL4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufaf3Q9JKL4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufaf3Q9JKL4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufaf3Q9JKL4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufaf3Q9JKL4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufaf3Q9JKL4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufaf3Q9JKL4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufaf3Q9JKL4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufaf3Q9JKL4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufaf3Q9JKL4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufaf3Q9JKL4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufaf3Q9JKL4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufaf3Q9JKL4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufaf3Q9JKL4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufaf3Q9JKL4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufaf3Q9JKL4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndufaf3Q9JKL4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufaf3Q9JKL4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufaf3Q9JKL4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufaf3Q9JKL4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufaf3Q9JKL4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufaf3Q9JKL4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufaf3Q9JKL4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufaf3Q9JKL4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufaf3Q9JKL4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufaf3Q9JKL4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufaf3Q9JKL4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufaf3Q9JKL4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufaf3Q9JKL4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufaf3Q9JKL4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufaf3Q9JKL4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufaf3Q9JKL4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufaf3Q9JKL4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf3Q9JKL4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf3Q9JKL4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufaf3Q9JKL4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufaf3Q9JKL4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufaf3Q9JKL4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufaf3Q9JKL4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufaf3Q9JKL4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufaf3Q9JKL4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufaf3Q9JKL4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufaf3Q9JKL4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufaf3Q9JKL4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms