Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ap4m1Q9JKC7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ap4m1Q9JKC7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ap4m1Q9JKC7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ap4m1Q9JKC7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ap4m1Q9JKC7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ap4m1Q9JKC7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ap4m1Q9JKC7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ap4m1Q9JKC7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ap4m1Q9JKC7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ap4m1Q9JKC7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ap4m1Q9JKC7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ap4m1Q9JKC7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ap4m1Q9JKC7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ap4m1Q9JKC7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ap4m1Q9JKC7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ap4m1Q9JKC7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ap4m1Q9JKC7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ap4m1Q9JKC7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ap4m1Q9JKC7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ap4m1Q9JKC7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ap4m1Q9JKC7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ap4m1Q9JKC7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ap4m1Q9JKC7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ap4m1Q9JKC7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ap4m1Q9JKC7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ap4m1Q9JKC7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ap4m1Q9JKC7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ap4m1Q9JKC7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ap4m1Q9JKC7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ap4m1Q9JKC7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ap4m1Q9JKC7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ap4m1Q9JKC7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ap4m1Q9JKC7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ap4m1Q9JKC7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ap4m1Q9JKC7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ap4m1Q9JKC7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ap4m1Q9JKC7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ap4m1Q9JKC7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ap4m1Q9JKC7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ap4m1Q9JKC7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ap4m1Q9JKC7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ap4m1Q9JKC7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ap4m1Q9JKC7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ap4m1Q9JKC7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ap4m1Q9JKC7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ap4m1Q9JKC7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ap4m1Q9JKC7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ap4m1Q9JKC7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ap4m1Q9JKC7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ap4m1Q9JKC7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ap4m1Q9JKC7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ap4m1Q9JKC7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ap4m1Q9JKC7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ap4m1Q9JKC7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ap4m1Q9JKC7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ap4m1Q9JKC7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ap4m1Q9JKC7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ap4m1Q9JKC7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ap4m1Q9JKC7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ap4m1Q9JKC7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ap4m1Q9JKC7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap4m1Q9JKC7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap4m1Q9JKC7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ap4m1Q9JKC7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap4m1Q9JKC7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap4m1Q9JKC7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ap4m1Q9JKC7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap4m1Q9JKC7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ap4m1Q9JKC7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ap4m1Q9JKC7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap4m1Q9JKC7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ap4m1Q9JKC7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ap4m1Q9JKC7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ap4m1Q9JKC7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ap4m1Q9JKC7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap4m1Q9JKC7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ap4m1Q9JKC7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ap4m1Q9JKC7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ap4m1Q9JKC7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ap4m1Q9JKC7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ap4m1Q9JKC7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap4m1Q9JKC7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap4m1Q9JKC7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap4m1Q9JKC7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap4m1Q9JKC7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap4m1Q9JKC7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap4m1Q9JKC7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap4m1Q9JKC7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap4m1Q9JKC7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.6 ms