Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnmb4Q9JIN6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnmb4Q9JIN6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnmb4Q9JIN6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnmb4Q9JIN6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnmb4Q9JIN6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnmb4Q9JIN6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnmb4Q9JIN6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnmb4Q9JIN6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnmb4Q9JIN6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnmb4Q9JIN6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnmb4Q9JIN6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnmb4Q9JIN6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnmb4Q9JIN6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnmb4Q9JIN6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnmb4Q9JIN6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnmb4Q9JIN6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnmb4Q9JIN6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnmb4Q9JIN6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnmb4Q9JIN6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnmb4Q9JIN6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnmb4Q9JIN6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnmb4Q9JIN6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnmb4Q9JIN6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnmb4Q9JIN6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnmb4Q9JIN6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnmb4Q9JIN6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnmb4Q9JIN6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnmb4Q9JIN6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnmb4Q9JIN6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnmb4Q9JIN6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnmb4Q9JIN6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnmb4Q9JIN6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnmb4Q9JIN6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnmb4Q9JIN6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnmb4Q9JIN6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnmb4Q9JIN6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnmb4Q9JIN6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnmb4Q9JIN6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnmb4Q9JIN6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnmb4Q9JIN6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnmb4Q9JIN6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnmb4Q9JIN6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnmb4Q9JIN6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnmb4Q9JIN6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnmb4Q9JIN6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnmb4Q9JIN6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnmb4Q9JIN6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnmb4Q9JIN6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnmb4Q9JIN6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnmb4Q9JIN6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnmb4Q9JIN6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnmb4Q9JIN6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnmb4Q9JIN6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnmb4Q9JIN6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnmb4Q9JIN6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnmb4Q9JIN6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnmb4Q9JIN6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnmb4Q9JIN6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnmb4Q9JIN6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnmb4Q9JIN6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnmb4Q9JIN6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnmb4Q9JIN6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kcnmb4Q9JIN6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnmb4Q9JIN6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnmb4Q9JIN6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnmb4Q9JIN6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnmb4Q9JIN6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnmb4Q9JIN6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnmb4Q9JIN6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnmb4Q9JIN6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnmb4Q9JIN6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnmb4Q9JIN6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnmb4Q9JIN6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnmb4Q9JIN6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnmb4Q9JIN6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnmb4Q9JIN6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnmb4Q9JIN6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnmb4Q9JIN6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnmb4Q9JIN6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnmb4Q9JIN6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnmb4Q9JIN6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnmb4Q9JIN6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnmb4Q9JIN6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnmb4Q9JIN6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnmb4Q9JIN6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnmb4Q9JIN6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnmb4Q9JIN6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnmb4Q9JIN6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnmb4Q9JIN6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnmb4Q9JIN6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnmb4Q9JIN6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnmb4Q9JIN6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms