Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Aldh1a3Q9JHW9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Aldh1a3Q9JHW9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Aldh1a3Q9JHW9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Aldh1a3Q9JHW9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Aldh1a3Q9JHW9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Aldh1a3Q9JHW9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Aldh1a3Q9JHW9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Aldh1a3Q9JHW9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Aldh1a3Q9JHW9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Aldh1a3Q9JHW9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Aldh1a3Q9JHW9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Aldh1a3Q9JHW9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Aldh1a3Q9JHW9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Aldh1a3Q9JHW9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Aldh1a3Q9JHW9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Aldh1a3Q9JHW9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Aldh1a3Q9JHW9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Aldh1a3Q9JHW9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Aldh1a3Q9JHW9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Aldh1a3Q9JHW9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Aldh1a3Q9JHW9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Aldh1a3Q9JHW9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Aldh1a3Q9JHW9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Aldh1a3Q9JHW9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Aldh1a3Q9JHW9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Aldh1a3Q9JHW9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Aldh1a3Q9JHW9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Aldh1a3Q9JHW9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Aldh1a3Q9JHW9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Aldh1a3Q9JHW9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Aldh1a3Q9JHW9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Aldh1a3Q9JHW9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Aldh1a3Q9JHW9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Aldh1a3Q9JHW9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Aldh1a3Q9JHW9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Aldh1a3Q9JHW9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Aldh1a3Q9JHW9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Aldh1a3Q9JHW9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Aldh1a3Q9JHW9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Aldh1a3Q9JHW9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Aldh1a3Q9JHW9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Aldh1a3Q9JHW9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Aldh1a3Q9JHW9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Aldh1a3Q9JHW9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Aldh1a3Q9JHW9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Aldh1a3Q9JHW9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Aldh1a3Q9JHW9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Aldh1a3Q9JHW9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Aldh1a3Q9JHW9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Aldh1a3Q9JHW9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Aldh1a3Q9JHW9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Aldh1a3Q9JHW9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Aldh1a3Q9JHW9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Aldh1a3Q9JHW9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Aldh1a3Q9JHW9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Aldh1a3Q9JHW9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Aldh1a3Q9JHW9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Aldh1a3Q9JHW9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Aldh1a3Q9JHW9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Aldh1a3Q9JHW9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Aldh1a3Q9JHW9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Aldh1a3Q9JHW9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Aldh1a3Q9JHW9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Aldh1a3Q9JHW9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Aldh1a3Q9JHW9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Aldh1a3Q9JHW9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Aldh1a3Q9JHW9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Aldh1a3Q9JHW9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Aldh1a3Q9JHW9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Aldh1a3Q9JHW9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Aldh1a3Q9JHW9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Aldh1a3Q9JHW9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Aldh1a3Q9JHW9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Aldh1a3Q9JHW9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Aldh1a3Q9JHW9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Aldh1a3Q9JHW9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Aldh1a3Q9JHW9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Aldh1a3Q9JHW9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Aldh1a3Q9JHW9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Aldh1a3Q9JHW9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Aldh1a3Q9JHW9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Aldh1a3Q9JHW9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Aldh1a3Q9JHW9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms