Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RabggtaQ9JHK4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RabggtaQ9JHK4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RabggtaQ9JHK4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RabggtaQ9JHK4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RabggtaQ9JHK4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RabggtaQ9JHK4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RabggtaQ9JHK4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RabggtaQ9JHK4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RabggtaQ9JHK4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RabggtaQ9JHK4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RabggtaQ9JHK4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RabggtaQ9JHK4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RabggtaQ9JHK4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RabggtaQ9JHK4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RabggtaQ9JHK4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RabggtaQ9JHK4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RabggtaQ9JHK4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RabggtaQ9JHK4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
RabggtaQ9JHK4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RabggtaQ9JHK4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RabggtaQ9JHK4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RabggtaQ9JHK4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RabggtaQ9JHK4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RabggtaQ9JHK4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RabggtaQ9JHK4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RabggtaQ9JHK4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RabggtaQ9JHK4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RabggtaQ9JHK4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RabggtaQ9JHK4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RabggtaQ9JHK4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RabggtaQ9JHK4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RabggtaQ9JHK4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RabggtaQ9JHK4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RabggtaQ9JHK4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RabggtaQ9JHK4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RabggtaQ9JHK4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RabggtaQ9JHK4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RabggtaQ9JHK4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RabggtaQ9JHK4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RabggtaQ9JHK4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RabggtaQ9JHK4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RabggtaQ9JHK4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RabggtaQ9JHK4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RabggtaQ9JHK4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RabggtaQ9JHK4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RabggtaQ9JHK4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RabggtaQ9JHK4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RabggtaQ9JHK4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
RabggtaQ9JHK4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RabggtaQ9JHK4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RabggtaQ9JHK4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RabggtaQ9JHK4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RabggtaQ9JHK4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RabggtaQ9JHK4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RabggtaQ9JHK4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RabggtaQ9JHK4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RabggtaQ9JHK4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RabggtaQ9JHK4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RabggtaQ9JHK4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RabggtaQ9JHK4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RabggtaQ9JHK4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RabggtaQ9JHK4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RabggtaQ9JHK4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RabggtaQ9JHK4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RabggtaQ9JHK4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RabggtaQ9JHK4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RabggtaQ9JHK4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RabggtaQ9JHK4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RabggtaQ9JHK4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RabggtaQ9JHK4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RabggtaQ9JHK4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RabggtaQ9JHK4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RabggtaQ9JHK4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RabggtaQ9JHK4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RabggtaQ9JHK4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RabggtaQ9JHK4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RabggtaQ9JHK4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RabggtaQ9JHK4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RabggtaQ9JHK4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RabggtaQ9JHK4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RabggtaQ9JHK4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RabggtaQ9JHK4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RabggtaQ9JHK4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RabggtaQ9JHK4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RabggtaQ9JHK4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RabggtaQ9JHK4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RabggtaQ9JHK4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RabggtaQ9JHK4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RabggtaQ9JHK4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RabggtaQ9JHK4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RabggtaQ9JHK4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RabggtaQ9JHK4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RabggtaQ9JHK4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RabggtaQ9JHK4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RabggtaQ9JHK4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RabggtaQ9JHK4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RabggtaQ9JHK4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms