Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn12Q9ET43 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn12Q9ET43 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn12Q9ET43 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn12Q9ET43 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn12Q9ET43 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn12Q9ET43 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn12Q9ET43 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn12Q9ET43 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn12Q9ET43 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cldn12Q9ET43 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn12Q9ET43 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn12Q9ET43 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn12Q9ET43 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn12Q9ET43 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn12Q9ET43 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn12Q9ET43 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn12Q9ET43 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn12Q9ET43 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn12Q9ET43 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn12Q9ET43 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn12Q9ET43 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn12Q9ET43 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn12Q9ET43 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldn12Q9ET43 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldn12Q9ET43 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn12Q9ET43 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn12Q9ET43 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn12Q9ET43 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn12Q9ET43 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn12Q9ET43 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn12Q9ET43 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn12Q9ET43 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn12Q9ET43 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn12Q9ET43 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn12Q9ET43 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn12Q9ET43 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn12Q9ET43 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn12Q9ET43 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn12Q9ET43 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn12Q9ET43 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn12Q9ET43 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn12Q9ET43 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn12Q9ET43 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn12Q9ET43 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn12Q9ET43 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn12Q9ET43 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn12Q9ET43 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn12Q9ET43 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn12Q9ET43 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn12Q9ET43 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn12Q9ET43 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn12Q9ET43 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn12Q9ET43 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn12Q9ET43 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn12Q9ET43 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn12Q9ET43 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn12Q9ET43 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn12Q9ET43 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn12Q9ET43 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn12Q9ET43 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn12Q9ET43 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn12Q9ET43 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn12Q9ET43 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn12Q9ET43 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn12Q9ET43 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn12Q9ET43 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn12Q9ET43 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn12Q9ET43 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn12Q9ET43 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn12Q9ET43 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn12Q9ET43 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn12Q9ET43 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn12Q9ET43 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn12Q9ET43 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 288 ms