Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a4bQ9ES61 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a4bQ9ES61 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a4bQ9ES61 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a4bQ9ES61 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a4bQ9ES61 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a4bQ9ES61 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a4bQ9ES61 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a4bQ9ES61 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a4bQ9ES61 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a4bQ9ES61 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ms4a4bQ9ES61 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a4bQ9ES61 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a4bQ9ES61 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a4bQ9ES61 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a4bQ9ES61 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a4bQ9ES61 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a4bQ9ES61 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a4bQ9ES61 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a4bQ9ES61 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a4bQ9ES61 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a4bQ9ES61 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a4bQ9ES61 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a4bQ9ES61 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a4bQ9ES61 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a4bQ9ES61 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a4bQ9ES61 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a4bQ9ES61 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a4bQ9ES61 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a4bQ9ES61 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a4bQ9ES61 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a4bQ9ES61 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ms4a4bQ9ES61 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4bQ9ES61 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4bQ9ES61 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4bQ9ES61 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4bQ9ES61 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ms4a4bQ9ES61 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a4bQ9ES61 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ms4a4bQ9ES61 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ms4a4bQ9ES61 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ms4a4bQ9ES61 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ms4a4bQ9ES61 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ms4a4bQ9ES61 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ms4a4bQ9ES61 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a4bQ9ES61 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a4bQ9ES61 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ms4a4bQ9ES61 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a4bQ9ES61 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a4bQ9ES61 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a4bQ9ES61 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ms4a4bQ9ES61 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ms4a4bQ9ES61 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms