Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR1

Ndel1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndel1Q9ERR1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndel1Q9ERR1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndel1Q9ERR1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndel1Q9ERR1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndel1Q9ERR1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndel1Q9ERR1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ndel1Q9ERR1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndel1Q9ERR1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndel1Q9ERR1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndel1Q9ERR1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndel1Q9ERR1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndel1Q9ERR1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndel1Q9ERR1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndel1Q9ERR1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndel1Q9ERR1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndel1Q9ERR1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndel1Q9ERR1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndel1Q9ERR1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndel1Q9ERR1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndel1Q9ERR1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndel1Q9ERR1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndel1Q9ERR1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndel1Q9ERR1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndel1Q9ERR1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndel1Q9ERR1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndel1Q9ERR1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndel1Q9ERR1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndel1Q9ERR1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndel1Q9ERR1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndel1Q9ERR1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndel1Q9ERR1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndel1Q9ERR1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndel1Q9ERR1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndel1Q9ERR1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndel1Q9ERR1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndel1Q9ERR1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndel1Q9ERR1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndel1Q9ERR1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndel1Q9ERR1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndel1Q9ERR1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndel1Q9ERR1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndel1Q9ERR1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndel1Q9ERR1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndel1Q9ERR1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndel1Q9ERR1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndel1Q9ERR1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ndel1Q9ERR1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndel1Q9ERR1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ndel1Q9ERR1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ndel1Q9ERR1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndel1Q9ERR1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndel1Q9ERR1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndel1Q9ERR1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndel1Q9ERR1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndel1Q9ERR1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndel1Q9ERR1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndel1Q9ERR1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndel1Q9ERR1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndel1Q9ERR1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndel1Q9ERR1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndel1Q9ERR1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndel1Q9ERR1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ndel1Q9ERR1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms