Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dap3Q9ER88 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dap3Q9ER88 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dap3Q9ER88 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dap3Q9ER88 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dap3Q9ER88 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dap3Q9ER88 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dap3Q9ER88 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dap3Q9ER88 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dap3Q9ER88 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Dap3Q9ER88 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dap3Q9ER88 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dap3Q9ER88 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dap3Q9ER88 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dap3Q9ER88 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dap3Q9ER88 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dap3Q9ER88 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dap3Q9ER88 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dap3Q9ER88 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Dap3Q9ER88 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Dap3Q9ER88 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dap3Q9ER88 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dap3Q9ER88 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dap3Q9ER88 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dap3Q9ER88 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dap3Q9ER88 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dap3Q9ER88 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dap3Q9ER88 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dap3Q9ER88 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dap3Q9ER88 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Dap3Q9ER88 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dap3Q9ER88 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dap3Q9ER88 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dap3Q9ER88 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dap3Q9ER88 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dap3Q9ER88 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dap3Q9ER88 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dap3Q9ER88 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dap3Q9ER88 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dap3Q9ER88 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dap3Q9ER88 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dap3Q9ER88 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dap3Q9ER88 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dap3Q9ER88 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dap3Q9ER88 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dap3Q9ER88 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Dap3Q9ER88 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dap3Q9ER88 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dap3Q9ER88 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dap3Q9ER88 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dap3Q9ER88 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dap3Q9ER88 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dap3Q9ER88 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dap3Q9ER88 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dap3Q9ER88 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dap3Q9ER88 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dap3Q9ER88 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dap3Q9ER88 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dap3Q9ER88 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Dap3Q9ER88 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dap3Q9ER88 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dap3Q9ER88 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dap3Q9ER88 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dap3Q9ER88 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dap3Q9ER88 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dap3Q9ER88 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dap3Q9ER88 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dap3Q9ER88 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dap3Q9ER88 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dap3Q9ER88 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dap3Q9ER88 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dap3Q9ER88 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dap3Q9ER88 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dap3Q9ER88 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dap3Q9ER88 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dap3Q9ER88 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dap3Q9ER88 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dap3Q9ER88 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dap3Q9ER88 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dap3Q9ER88 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dap3Q9ER88 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dap3Q9ER88 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dap3Q9ER88 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dap3Q9ER88 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dap3Q9ER88 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dap3Q9ER88 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dap3Q9ER88 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dap3Q9ER88 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dap3Q9ER88 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dap3Q9ER88 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dap3Q9ER88 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dap3Q9ER88 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dap3Q9ER88 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dap3Q9ER88 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dap3Q9ER88 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dap3Q9ER88 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dap3Q9ER88 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dap3Q9ER88 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dap3Q9ER88 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dap3Q9ER88 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms